Protein–RNA interactions for Protein: G5E8X0

Cldn20, Claudin, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn20G5E8X0 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cldn20G5E8X0 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cldn20G5E8X0 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cldn20G5E8X0 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cldn20G5E8X0 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cldn20G5E8X0 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cldn20G5E8X0 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cldn20G5E8X0 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cldn20G5E8X0 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cldn20G5E8X0 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cldn20G5E8X0 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cldn20G5E8X0 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cldn20G5E8X0 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cldn20G5E8X0 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cldn20G5E8X0 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cldn20G5E8X0 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cldn20G5E8X0 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cldn20G5E8X0 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Cldn20G5E8X0 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cldn20G5E8X0 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cldn20G5E8X0 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cldn20G5E8X0 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cldn20G5E8X0 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Cldn20G5E8X0 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cldn20G5E8X0 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cldn20G5E8X0 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cldn20G5E8X0 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cldn20G5E8X0 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cldn20G5E8X0 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cldn20G5E8X0 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cldn20G5E8X0 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cldn20G5E8X0 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cldn20G5E8X0 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cldn20G5E8X0 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cldn20G5E8X0 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cldn20G5E8X0 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cldn20G5E8X0 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cldn20G5E8X0 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cldn20G5E8X0 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cldn20G5E8X0 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn20G5E8X0 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn20G5E8X0 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn20G5E8X0 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn20G5E8X0 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn20G5E8X0 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn20G5E8X0 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn20G5E8X0 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn20G5E8X0 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn20G5E8X0 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn20G5E8X0 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn20G5E8X0 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn20G5E8X0 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn20G5E8X0 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn20G5E8X0 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn20G5E8X0 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn20G5E8X0 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn20G5E8X0 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn20G5E8X0 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn20G5E8X0 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn20G5E8X0 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn20G5E8X0 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn20G5E8X0 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn20G5E8X0 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn20G5E8X0 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn20G5E8X0 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn20G5E8X0 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn20G5E8X0 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn20G5E8X0 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn20G5E8X0 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn20G5E8X0 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn20G5E8X0 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn20G5E8X0 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn20G5E8X0 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn20G5E8X0 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn20G5E8X0 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn20G5E8X0 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn20G5E8X0 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn20G5E8X0 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn20G5E8X0 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn20G5E8X0 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn20G5E8X0 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn20G5E8X0 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn20G5E8X0 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn20G5E8X0 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn20G5E8X0 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn20G5E8X0 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn20G5E8X0 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn20G5E8X0 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn20G5E8X0 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn20G5E8X0 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn20G5E8X0 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cldn20G5E8X0 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cldn20G5E8X0 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cldn20G5E8X0 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cldn20G5E8X0 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cldn20G5E8X0 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cldn20G5E8X0 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Cldn20G5E8X0 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cldn20G5E8X0 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cldn20G5E8X0 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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