Protein–RNA interactions for Protein: G5E8V9

Arfip1, ADP-ribosylation factor-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arfip1G5E8V9 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Arfip1G5E8V9 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Arfip1G5E8V9 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Arfip1G5E8V9 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Arfip1G5E8V9 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Arfip1G5E8V9 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Arfip1G5E8V9 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Arfip1G5E8V9 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Arfip1G5E8V9 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Arfip1G5E8V9 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Arfip1G5E8V9 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Arfip1G5E8V9 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Arfip1G5E8V9 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Arfip1G5E8V9 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Arfip1G5E8V9 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Arfip1G5E8V9 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Arfip1G5E8V9 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Arfip1G5E8V9 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Arfip1G5E8V9 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Arfip1G5E8V9 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Arfip1G5E8V9 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Arfip1G5E8V9 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Arfip1G5E8V9 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Arfip1G5E8V9 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Arfip1G5E8V9 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Arfip1G5E8V9 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Arfip1G5E8V9 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Arfip1G5E8V9 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Arfip1G5E8V9 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Arfip1G5E8V9 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Arfip1G5E8V9 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Arfip1G5E8V9 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Arfip1G5E8V9 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Arfip1G5E8V9 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Arfip1G5E8V9 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Arfip1G5E8V9 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Arfip1G5E8V9 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Arfip1G5E8V9 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Arfip1G5E8V9 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Arfip1G5E8V9 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Arfip1G5E8V9 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Arfip1G5E8V9 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Arfip1G5E8V9 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Arfip1G5E8V9 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Arfip1G5E8V9 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Arfip1G5E8V9 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Arfip1G5E8V9 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Arfip1G5E8V9 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Arfip1G5E8V9 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Arfip1G5E8V9 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Arfip1G5E8V9 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Arfip1G5E8V9 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Arfip1G5E8V9 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Arfip1G5E8V9 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Arfip1G5E8V9 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Arfip1G5E8V9 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Arfip1G5E8V9 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Arfip1G5E8V9 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Arfip1G5E8V9 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Arfip1G5E8V9 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Arfip1G5E8V9 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Arfip1G5E8V9 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Arfip1G5E8V9 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Arfip1G5E8V9 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Arfip1G5E8V9 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Arfip1G5E8V9 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Arfip1G5E8V9 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Arfip1G5E8V9 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Arfip1G5E8V9 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Arfip1G5E8V9 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Arfip1G5E8V9 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Arfip1G5E8V9 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Arfip1G5E8V9 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Arfip1G5E8V9 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Arfip1G5E8V9 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Arfip1G5E8V9 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Arfip1G5E8V9 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Arfip1G5E8V9 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Arfip1G5E8V9 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Arfip1G5E8V9 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Arfip1G5E8V9 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Arfip1G5E8V9 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Arfip1G5E8V9 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Arfip1G5E8V9 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Arfip1G5E8V9 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Arfip1G5E8V9 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Arfip1G5E8V9 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Arfip1G5E8V9 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Arfip1G5E8V9 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Arfip1G5E8V9 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Arfip1G5E8V9 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Arfip1G5E8V9 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Arfip1G5E8V9 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Arfip1G5E8V9 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Arfip1G5E8V9 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Arfip1G5E8V9 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Arfip1G5E8V9 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Arfip1G5E8V9 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Arfip1G5E8V9 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Arfip1G5E8V9 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.5 ms