Protein–RNA interactions for Protein: G3X9C2

Nccrp1, F-box only protein 50, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nccrp1G3X9C2 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nccrp1G3X9C2 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nccrp1G3X9C2 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Nccrp1G3X9C2 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nccrp1G3X9C2 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nccrp1G3X9C2 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nccrp1G3X9C2 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nccrp1G3X9C2 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nccrp1G3X9C2 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nccrp1G3X9C2 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nccrp1G3X9C2 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nccrp1G3X9C2 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nccrp1G3X9C2 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nccrp1G3X9C2 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nccrp1G3X9C2 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nccrp1G3X9C2 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Nccrp1G3X9C2 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nccrp1G3X9C2 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nccrp1G3X9C2 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nccrp1G3X9C2 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nccrp1G3X9C2 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nccrp1G3X9C2 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nccrp1G3X9C2 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nccrp1G3X9C2 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nccrp1G3X9C2 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nccrp1G3X9C2 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nccrp1G3X9C2 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nccrp1G3X9C2 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nccrp1G3X9C2 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nccrp1G3X9C2 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nccrp1G3X9C2 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nccrp1G3X9C2 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Nccrp1G3X9C2 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nccrp1G3X9C2 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Nccrp1G3X9C2 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nccrp1G3X9C2 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nccrp1G3X9C2 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nccrp1G3X9C2 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nccrp1G3X9C2 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nccrp1G3X9C2 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nccrp1G3X9C2 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nccrp1G3X9C2 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nccrp1G3X9C2 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Nccrp1G3X9C2 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nccrp1G3X9C2 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nccrp1G3X9C2 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nccrp1G3X9C2 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nccrp1G3X9C2 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nccrp1G3X9C2 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nccrp1G3X9C2 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nccrp1G3X9C2 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nccrp1G3X9C2 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nccrp1G3X9C2 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Nccrp1G3X9C2 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nccrp1G3X9C2 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nccrp1G3X9C2 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nccrp1G3X9C2 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nccrp1G3X9C2 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Nccrp1G3X9C2 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Nccrp1G3X9C2 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Nccrp1G3X9C2 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nccrp1G3X9C2 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nccrp1G3X9C2 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nccrp1G3X9C2 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nccrp1G3X9C2 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nccrp1G3X9C2 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nccrp1G3X9C2 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nccrp1G3X9C2 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nccrp1G3X9C2 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nccrp1G3X9C2 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nccrp1G3X9C2 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nccrp1G3X9C2 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nccrp1G3X9C2 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nccrp1G3X9C2 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nccrp1G3X9C2 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nccrp1G3X9C2 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nccrp1G3X9C2 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Nccrp1G3X9C2 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nccrp1G3X9C2 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nccrp1G3X9C2 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nccrp1G3X9C2 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nccrp1G3X9C2 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nccrp1G3X9C2 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nccrp1G3X9C2 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nccrp1G3X9C2 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nccrp1G3X9C2 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nccrp1G3X9C2 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nccrp1G3X9C2 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nccrp1G3X9C2 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nccrp1G3X9C2 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Nccrp1G3X9C2 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nccrp1G3X9C2 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nccrp1G3X9C2 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nccrp1G3X9C2 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nccrp1G3X9C2 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nccrp1G3X9C2 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nccrp1G3X9C2 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nccrp1G3X9C2 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nccrp1G3X9C2 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nccrp1G3X9C2 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms