Protein–RNA interactions for Protein: G3X939

Slc9a3, Sodium/hydrogen exchanger 3, mousemouse

Predictions only

Length 829 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc9a3G3X939 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slc9a3G3X939 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slc9a3G3X939 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slc9a3G3X939 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Slc9a3G3X939 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Slc9a3G3X939 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Slc9a3G3X939 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Slc9a3G3X939 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Slc9a3G3X939 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Slc9a3G3X939 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Slc9a3G3X939 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Slc9a3G3X939 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Slc9a3G3X939 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Slc9a3G3X939 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Slc9a3G3X939 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Slc9a3G3X939 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Slc9a3G3X939 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Slc9a3G3X939 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Slc9a3G3X939 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Slc9a3G3X939 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Slc9a3G3X939 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Slc9a3G3X939 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Slc9a3G3X939 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Slc9a3G3X939 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Slc9a3G3X939 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Slc9a3G3X939 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Slc9a3G3X939 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Slc9a3G3X939 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Slc9a3G3X939 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Slc9a3G3X939 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Slc9a3G3X939 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Slc9a3G3X939 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Slc9a3G3X939 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Slc9a3G3X939 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Slc9a3G3X939 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Slc9a3G3X939 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Slc9a3G3X939 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Slc9a3G3X939 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Slc9a3G3X939 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Slc9a3G3X939 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Slc9a3G3X939 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Slc9a3G3X939 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Slc9a3G3X939 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Slc9a3G3X939 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Slc9a3G3X939 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Slc9a3G3X939 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Slc9a3G3X939 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Slc9a3G3X939 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Slc9a3G3X939 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Slc9a3G3X939 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Slc9a3G3X939 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Slc9a3G3X939 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Slc9a3G3X939 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Slc9a3G3X939 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Slc9a3G3X939 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Slc9a3G3X939 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Slc9a3G3X939 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Slc9a3G3X939 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Slc9a3G3X939 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Slc9a3G3X939 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Slc9a3G3X939 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Slc9a3G3X939 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Slc9a3G3X939 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Slc9a3G3X939 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Slc9a3G3X939 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Slc9a3G3X939 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Slc9a3G3X939 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Slc9a3G3X939 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Slc9a3G3X939 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Slc9a3G3X939 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Slc9a3G3X939 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Slc9a3G3X939 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Slc9a3G3X939 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Slc9a3G3X939 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Slc9a3G3X939 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Slc9a3G3X939 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Slc9a3G3X939 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Slc9a3G3X939 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Slc9a3G3X939 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Slc9a3G3X939 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Slc9a3G3X939 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Slc9a3G3X939 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Slc9a3G3X939 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Slc9a3G3X939 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Slc9a3G3X939 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slc9a3G3X939 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slc9a3G3X939 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slc9a3G3X939 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slc9a3G3X939 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slc9a3G3X939 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slc9a3G3X939 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slc9a3G3X939 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slc9a3G3X939 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slc9a3G3X939 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slc9a3G3X939 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slc9a3G3X939 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slc9a3G3X939 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slc9a3G3X939 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slc9a3G3X939 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slc9a3G3X939 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms