Protein–RNA interactions for Protein: G3UVU6

Gm20517, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 20, mousemouse

Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20517G3UVU6 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm20517G3UVU6 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm20517G3UVU6 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm20517G3UVU6 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm20517G3UVU6 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm20517G3UVU6 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm20517G3UVU6 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm20517G3UVU6 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm20517G3UVU6 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm20517G3UVU6 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm20517G3UVU6 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm20517G3UVU6 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm20517G3UVU6 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm20517G3UVU6 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm20517G3UVU6 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm20517G3UVU6 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm20517G3UVU6 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm20517G3UVU6 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm20517G3UVU6 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm20517G3UVU6 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Gm20517G3UVU6 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Gm20517G3UVU6 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Gm20517G3UVU6 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Gm20517G3UVU6 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC11.46□□□□□ -0.58
Gm20517G3UVU6 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Gm20517G3UVU6 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Gm20517G3UVU6 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Gm20517G3UVU6 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Gm20517G3UVU6 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Gm20517G3UVU6 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Gm20517G3UVU6 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Gm20517G3UVU6 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Gm20517G3UVU6 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Gm20517G3UVU6 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Gm20517G3UVU6 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Gm20517G3UVU6 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm20517G3UVU6 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm20517G3UVU6 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm20517G3UVU6 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm20517G3UVU6 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm20517G3UVU6 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm20517G3UVU6 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm20517G3UVU6 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm20517G3UVU6 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm20517G3UVU6 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm20517G3UVU6 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm20517G3UVU6 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm20517G3UVU6 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm20517G3UVU6 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm20517G3UVU6 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm20517G3UVU6 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm20517G3UVU6 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm20517G3UVU6 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm20517G3UVU6 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm20517G3UVU6 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm20517G3UVU6 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm20517G3UVU6 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm20517G3UVU6 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm20517G3UVU6 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm20517G3UVU6 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm20517G3UVU6 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm20517G3UVU6 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm20517G3UVU6 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm20517G3UVU6 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm20517G3UVU6 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm20517G3UVU6 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm20517G3UVU6 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm20517G3UVU6 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm20517G3UVU6 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm20517G3UVU6 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm20517G3UVU6 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm20517G3UVU6 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm20517G3UVU6 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm20517G3UVU6 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm20517G3UVU6 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm20517G3UVU6 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm20517G3UVU6 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm20517G3UVU6 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm20517G3UVU6 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm20517G3UVU6 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm20517G3UVU6 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm20517G3UVU6 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm20517G3UVU6 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm20517G3UVU6 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm20517G3UVU6 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm20517G3UVU6 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm20517G3UVU6 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm20517G3UVU6 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm20517G3UVU6 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm20517G3UVU6 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm20517G3UVU6 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm20517G3UVU6 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm20517G3UVU6 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm20517G3UVU6 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm20517G3UVU6 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm20517G3UVU6 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm20517G3UVU6 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm20517G3UVU6 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm20517G3UVU6 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm20517G3UVU6 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms