Protein–RNA interactions for Protein: F8VQM2

Ccl26, Chemokine (C-C motif) ligand 26, mousemouse

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Length 93 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl26F8VQM2 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccl26F8VQM2 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccl26F8VQM2 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccl26F8VQM2 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccl26F8VQM2 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccl26F8VQM2 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccl26F8VQM2 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccl26F8VQM2 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccl26F8VQM2 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccl26F8VQM2 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccl26F8VQM2 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccl26F8VQM2 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccl26F8VQM2 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccl26F8VQM2 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccl26F8VQM2 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccl26F8VQM2 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccl26F8VQM2 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccl26F8VQM2 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccl26F8VQM2 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccl26F8VQM2 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccl26F8VQM2 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccl26F8VQM2 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccl26F8VQM2 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccl26F8VQM2 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccl26F8VQM2 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccl26F8VQM2 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccl26F8VQM2 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccl26F8VQM2 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccl26F8VQM2 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccl26F8VQM2 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccl26F8VQM2 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccl26F8VQM2 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccl26F8VQM2 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccl26F8VQM2 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccl26F8VQM2 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccl26F8VQM2 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccl26F8VQM2 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccl26F8VQM2 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccl26F8VQM2 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccl26F8VQM2 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccl26F8VQM2 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccl26F8VQM2 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccl26F8VQM2 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccl26F8VQM2 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccl26F8VQM2 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccl26F8VQM2 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccl26F8VQM2 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccl26F8VQM2 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccl26F8VQM2 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccl26F8VQM2 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccl26F8VQM2 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccl26F8VQM2 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccl26F8VQM2 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccl26F8VQM2 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccl26F8VQM2 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccl26F8VQM2 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccl26F8VQM2 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccl26F8VQM2 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccl26F8VQM2 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccl26F8VQM2 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccl26F8VQM2 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccl26F8VQM2 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccl26F8VQM2 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccl26F8VQM2 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccl26F8VQM2 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccl26F8VQM2 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccl26F8VQM2 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccl26F8VQM2 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccl26F8VQM2 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccl26F8VQM2 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccl26F8VQM2 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccl26F8VQM2 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccl26F8VQM2 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccl26F8VQM2 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccl26F8VQM2 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccl26F8VQM2 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccl26F8VQM2 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccl26F8VQM2 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccl26F8VQM2 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccl26F8VQM2 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccl26F8VQM2 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccl26F8VQM2 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccl26F8VQM2 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccl26F8VQM2 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccl26F8VQM2 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccl26F8VQM2 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccl26F8VQM2 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccl26F8VQM2 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccl26F8VQM2 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccl26F8VQM2 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccl26F8VQM2 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccl26F8VQM2 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccl26F8VQM2 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccl26F8VQM2 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccl26F8VQM2 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccl26F8VQM2 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccl26F8VQM2 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccl26F8VQM2 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccl26F8VQM2 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccl26F8VQM2 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms