Protein–RNA interactions for Protein: F8VPU2

Farp1, FERM, ARHGEF and pleckstrin domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,048 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Farp1F8VPU2 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Farp1F8VPU2 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Farp1F8VPU2 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Farp1F8VPU2 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Farp1F8VPU2 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Farp1F8VPU2 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Farp1F8VPU2 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Farp1F8VPU2 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Farp1F8VPU2 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Farp1F8VPU2 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Farp1F8VPU2 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Farp1F8VPU2 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Farp1F8VPU2 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Farp1F8VPU2 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Farp1F8VPU2 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Farp1F8VPU2 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Farp1F8VPU2 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Farp1F8VPU2 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Farp1F8VPU2 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Farp1F8VPU2 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Farp1F8VPU2 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Farp1F8VPU2 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Farp1F8VPU2 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Farp1F8VPU2 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Farp1F8VPU2 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Farp1F8VPU2 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Farp1F8VPU2 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Farp1F8VPU2 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Farp1F8VPU2 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Farp1F8VPU2 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Farp1F8VPU2 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Farp1F8VPU2 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Farp1F8VPU2 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Farp1F8VPU2 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Farp1F8VPU2 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Farp1F8VPU2 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Farp1F8VPU2 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Farp1F8VPU2 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Farp1F8VPU2 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Farp1F8VPU2 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Farp1F8VPU2 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Farp1F8VPU2 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Farp1F8VPU2 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Farp1F8VPU2 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Farp1F8VPU2 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Farp1F8VPU2 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Farp1F8VPU2 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Farp1F8VPU2 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Farp1F8VPU2 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Farp1F8VPU2 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Farp1F8VPU2 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Farp1F8VPU2 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Farp1F8VPU2 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Farp1F8VPU2 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Farp1F8VPU2 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Farp1F8VPU2 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Farp1F8VPU2 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Farp1F8VPU2 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Farp1F8VPU2 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Farp1F8VPU2 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Farp1F8VPU2 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Farp1F8VPU2 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Farp1F8VPU2 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Farp1F8VPU2 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Farp1F8VPU2 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Farp1F8VPU2 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Farp1F8VPU2 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Farp1F8VPU2 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Farp1F8VPU2 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Farp1F8VPU2 Cklf-210ENSMUST00000212939 737 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Farp1F8VPU2 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Farp1F8VPU2 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Farp1F8VPU2 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Farp1F8VPU2 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Farp1F8VPU2 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Farp1F8VPU2 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Farp1F8VPU2 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Farp1F8VPU2 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Farp1F8VPU2 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Farp1F8VPU2 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Farp1F8VPU2 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Farp1F8VPU2 Gm26540-201ENSMUST00000181858 1310 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Farp1F8VPU2 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Farp1F8VPU2 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Farp1F8VPU2 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Farp1F8VPU2 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Farp1F8VPU2 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Farp1F8VPU2 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Farp1F8VPU2 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Farp1F8VPU2 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Farp1F8VPU2 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Farp1F8VPU2 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Farp1F8VPU2 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Farp1F8VPU2 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Farp1F8VPU2 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Farp1F8VPU2 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Farp1F8VPU2 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Farp1F8VPU2 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Farp1F8VPU2 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Farp1F8VPU2 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.1 ms