Protein–RNA interactions for Protein: F6Z9R1

Gm20538, Predicted gene 20538 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 75 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20538F6Z9R1 Amigo3-201ENSMUST00000085060 2543 ntAPPRIS P1 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Gm20538F6Z9R1 Gm43102-201ENSMUST00000201004 2324 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Gm20538F6Z9R1 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Gm20538F6Z9R1 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Gm20538F6Z9R1 Prr5l-210ENSMUST00000171088 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Gm20538F6Z9R1 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Gm20538F6Z9R1 Smg6-201ENSMUST00000045281 5848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Gm20538F6Z9R1 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Gm20538F6Z9R1 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Gm20538F6Z9R1 Gal3st2-201ENSMUST00000094663 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Gm20538F6Z9R1 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Gm20538F6Z9R1 Gtf2ird1-207ENSMUST00000111245 3299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Gm20538F6Z9R1 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Gm20538F6Z9R1 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Gm20538F6Z9R1 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Gm20538F6Z9R1 Samd4-206ENSMUST00000137543 6874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Gm20538F6Z9R1 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Gm20538F6Z9R1 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Gm20538F6Z9R1 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Gm20538F6Z9R1 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Gm20538F6Z9R1 Gm45191-201ENSMUST00000205846 5439 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Gm20538F6Z9R1 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Gm20538F6Z9R1 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Gm20538F6Z9R1 Ttc30b-201ENSMUST00000099996 2737 ntAPPRIS P1 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Gm20538F6Z9R1 Frmpd1-202ENSMUST00000107804 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Gm20538F6Z9R1 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Gm20538F6Z9R1 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Gm20538F6Z9R1 Htr2c-202ENSMUST00000096299 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Gm20538F6Z9R1 Gm5859-201ENSMUST00000165401 2324 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Gm20538F6Z9R1 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Gm20538F6Z9R1 5031434O11Rik-201ENSMUST00000180404 3731 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Gm20538F6Z9R1 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Gm20538F6Z9R1 Gm4454-201ENSMUST00000190585 2578 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Gm20538F6Z9R1 Zfp646-201ENSMUST00000050383 6310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Gm20538F6Z9R1 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Gm20538F6Z9R1 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Gm20538F6Z9R1 Olfr1090-202ENSMUST00000215991 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Gm20538F6Z9R1 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Gm20538F6Z9R1 Lgr5-201ENSMUST00000020350 4714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Gm20538F6Z9R1 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Gm20538F6Z9R1 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Gm20538F6Z9R1 Fntb-201ENSMUST00000041008 2613 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Gm20538F6Z9R1 Gm10548-201ENSMUST00000097631 2629 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Gm20538F6Z9R1 Gm18262-201ENSMUST00000222560 1946 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Gm20538F6Z9R1 Arhgef4-204ENSMUST00000159747 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Gm20538F6Z9R1 Zfp275-201ENSMUST00000033731 6376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Gm20538F6Z9R1 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Gm20538F6Z9R1 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Gm20538F6Z9R1 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Gm20538F6Z9R1 Zfhx2-201ENSMUST00000036328 10397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Gm20538F6Z9R1 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Gm20538F6Z9R1 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Gm20538F6Z9R1 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Gm20538F6Z9R1 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Gm20538F6Z9R1 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Gm20538F6Z9R1 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Gm20538F6Z9R1 Dnajc12-201ENSMUST00000043317 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Gm20538F6Z9R1 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Gm20538F6Z9R1 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Gm20538F6Z9R1 Ccdc63-201ENSMUST00000058960 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Gm20538F6Z9R1 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Gm20538F6Z9R1 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Gm20538F6Z9R1 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Gm20538F6Z9R1 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Gm20538F6Z9R1 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Gm20538F6Z9R1 Gm43221-201ENSMUST00000197612 2071 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Gm20538F6Z9R1 Zfand2a-202ENSMUST00000110851 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Gm20538F6Z9R1 Kat6b-207ENSMUST00000182855 6791 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Gm20538F6Z9R1 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Gm20538F6Z9R1 Lrp1-203ENSMUST00000121829 2887 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Gm20538F6Z9R1 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Gm20538F6Z9R1 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Gm20538F6Z9R1 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Gm20538F6Z9R1 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Gm20538F6Z9R1 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Gm20538F6Z9R1 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Gm20538F6Z9R1 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Gm20538F6Z9R1 Ogfod1-202ENSMUST00000093301 5141 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Gm20538F6Z9R1 Nup210-201ENSMUST00000032179 7037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Gm20538F6Z9R1 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Gm20538F6Z9R1 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Gm20538F6Z9R1 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Gm20538F6Z9R1 Map4-204ENSMUST00000164930 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Gm20538F6Z9R1 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Gm20538F6Z9R1 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Gm20538F6Z9R1 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Gm20538F6Z9R1 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Gm20538F6Z9R1 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Gm20538F6Z9R1 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Gm20538F6Z9R1 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Gm20538F6Z9R1 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Gm20538F6Z9R1 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Gm20538F6Z9R1 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Gm20538F6Z9R1 Gpld1-201ENSMUST00000021773 5224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Gm20538F6Z9R1 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Gm20538F6Z9R1 Zfp629-202ENSMUST00000084564 5829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Gm20538F6Z9R1 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Gm20538F6Z9R1 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Gm20538F6Z9R1 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Gm20538F6Z9R1 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms