Protein–RNA interactions for Protein: F6YKY3

Gm8005, Predicted gene 8005 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8005F6YKY3 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm8005F6YKY3 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm8005F6YKY3 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm8005F6YKY3 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm8005F6YKY3 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm8005F6YKY3 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm8005F6YKY3 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm8005F6YKY3 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm8005F6YKY3 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm8005F6YKY3 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm8005F6YKY3 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm8005F6YKY3 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm8005F6YKY3 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm8005F6YKY3 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm8005F6YKY3 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm8005F6YKY3 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm8005F6YKY3 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm8005F6YKY3 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm8005F6YKY3 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm8005F6YKY3 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm8005F6YKY3 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm8005F6YKY3 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm8005F6YKY3 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm8005F6YKY3 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm8005F6YKY3 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm8005F6YKY3 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm8005F6YKY3 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm8005F6YKY3 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm8005F6YKY3 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm8005F6YKY3 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm8005F6YKY3 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm8005F6YKY3 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm8005F6YKY3 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm8005F6YKY3 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm8005F6YKY3 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm8005F6YKY3 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm8005F6YKY3 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm8005F6YKY3 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm8005F6YKY3 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm8005F6YKY3 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm8005F6YKY3 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm8005F6YKY3 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm8005F6YKY3 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm8005F6YKY3 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm8005F6YKY3 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm8005F6YKY3 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm8005F6YKY3 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm8005F6YKY3 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm8005F6YKY3 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm8005F6YKY3 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm8005F6YKY3 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm8005F6YKY3 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm8005F6YKY3 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm8005F6YKY3 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm8005F6YKY3 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm8005F6YKY3 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm8005F6YKY3 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm8005F6YKY3 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm8005F6YKY3 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm8005F6YKY3 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm8005F6YKY3 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm8005F6YKY3 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm8005F6YKY3 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm8005F6YKY3 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm8005F6YKY3 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm8005F6YKY3 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm8005F6YKY3 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm8005F6YKY3 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm8005F6YKY3 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm8005F6YKY3 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm8005F6YKY3 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm8005F6YKY3 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm8005F6YKY3 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm8005F6YKY3 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm8005F6YKY3 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm8005F6YKY3 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm8005F6YKY3 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm8005F6YKY3 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm8005F6YKY3 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm8005F6YKY3 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm8005F6YKY3 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm8005F6YKY3 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm8005F6YKY3 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm8005F6YKY3 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm8005F6YKY3 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm8005F6YKY3 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm8005F6YKY3 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm8005F6YKY3 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm8005F6YKY3 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm8005F6YKY3 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm8005F6YKY3 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm8005F6YKY3 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm8005F6YKY3 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm8005F6YKY3 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm8005F6YKY3 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm8005F6YKY3 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm8005F6YKY3 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm8005F6YKY3 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm8005F6YKY3 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm8005F6YKY3 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
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