Protein–RNA interactions for Protein: F6SEU4

Syngap1, Ras/Rap GTPase-activating protein SynGAP, mousemouse

Predictions only

Length 1,340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syngap1F6SEU4 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Syngap1F6SEU4 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Syngap1F6SEU4 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Syngap1F6SEU4 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Syngap1F6SEU4 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Syngap1F6SEU4 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Syngap1F6SEU4 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Syngap1F6SEU4 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Syngap1F6SEU4 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Syngap1F6SEU4 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Syngap1F6SEU4 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Syngap1F6SEU4 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Syngap1F6SEU4 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Syngap1F6SEU4 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Syngap1F6SEU4 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Syngap1F6SEU4 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Syngap1F6SEU4 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Syngap1F6SEU4 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Syngap1F6SEU4 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Syngap1F6SEU4 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Syngap1F6SEU4 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Syngap1F6SEU4 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Syngap1F6SEU4 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Syngap1F6SEU4 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Syngap1F6SEU4 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Syngap1F6SEU4 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Syngap1F6SEU4 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Syngap1F6SEU4 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Syngap1F6SEU4 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Syngap1F6SEU4 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Syngap1F6SEU4 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Syngap1F6SEU4 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Syngap1F6SEU4 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Syngap1F6SEU4 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Syngap1F6SEU4 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Syngap1F6SEU4 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Syngap1F6SEU4 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Syngap1F6SEU4 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Syngap1F6SEU4 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Syngap1F6SEU4 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Syngap1F6SEU4 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Syngap1F6SEU4 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Syngap1F6SEU4 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Syngap1F6SEU4 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Syngap1F6SEU4 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Syngap1F6SEU4 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Syngap1F6SEU4 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Syngap1F6SEU4 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Syngap1F6SEU4 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Syngap1F6SEU4 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Syngap1F6SEU4 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Syngap1F6SEU4 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Syngap1F6SEU4 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Syngap1F6SEU4 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Syngap1F6SEU4 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Syngap1F6SEU4 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Syngap1F6SEU4 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Syngap1F6SEU4 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Syngap1F6SEU4 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Syngap1F6SEU4 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Syngap1F6SEU4 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Syngap1F6SEU4 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Syngap1F6SEU4 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Syngap1F6SEU4 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Syngap1F6SEU4 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Syngap1F6SEU4 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Syngap1F6SEU4 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Syngap1F6SEU4 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Syngap1F6SEU4 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Syngap1F6SEU4 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Syngap1F6SEU4 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Syngap1F6SEU4 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Syngap1F6SEU4 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Syngap1F6SEU4 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Syngap1F6SEU4 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Syngap1F6SEU4 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Syngap1F6SEU4 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Syngap1F6SEU4 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Syngap1F6SEU4 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Syngap1F6SEU4 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Syngap1F6SEU4 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Syngap1F6SEU4 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Syngap1F6SEU4 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Syngap1F6SEU4 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Syngap1F6SEU4 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Syngap1F6SEU4 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Syngap1F6SEU4 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Syngap1F6SEU4 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Syngap1F6SEU4 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Syngap1F6SEU4 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Syngap1F6SEU4 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Syngap1F6SEU4 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Syngap1F6SEU4 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Syngap1F6SEU4 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Syngap1F6SEU4 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Syngap1F6SEU4 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Syngap1F6SEU4 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Syngap1F6SEU4 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Syngap1F6SEU4 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Syngap1F6SEU4 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms