Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9D8

Ankrd35, Ankyrin repeat domain 35, mousemouse

Predictions only

Length 996 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ankrd35E9Q9D8 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Ankrd35E9Q9D8 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ankrd35E9Q9D8 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ankrd35E9Q9D8 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ankrd35E9Q9D8 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ankrd35E9Q9D8 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ankrd35E9Q9D8 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ankrd35E9Q9D8 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ankrd35E9Q9D8 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ankrd35E9Q9D8 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ankrd35E9Q9D8 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ankrd35E9Q9D8 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ankrd35E9Q9D8 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ankrd35E9Q9D8 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ankrd35E9Q9D8 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ankrd35E9Q9D8 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ankrd35E9Q9D8 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ankrd35E9Q9D8 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ankrd35E9Q9D8 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ankrd35E9Q9D8 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ankrd35E9Q9D8 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ankrd35E9Q9D8 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ankrd35E9Q9D8 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ankrd35E9Q9D8 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ankrd35E9Q9D8 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ankrd35E9Q9D8 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ankrd35E9Q9D8 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Ankrd35E9Q9D8 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ankrd35E9Q9D8 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ankrd35E9Q9D8 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ankrd35E9Q9D8 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ankrd35E9Q9D8 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ankrd35E9Q9D8 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ankrd35E9Q9D8 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ankrd35E9Q9D8 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ankrd35E9Q9D8 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Ankrd35E9Q9D8 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ankrd35E9Q9D8 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ankrd35E9Q9D8 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Ankrd35E9Q9D8 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Ankrd35E9Q9D8 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Ankrd35E9Q9D8 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ankrd35E9Q9D8 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ankrd35E9Q9D8 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ankrd35E9Q9D8 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ankrd35E9Q9D8 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ankrd35E9Q9D8 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ankrd35E9Q9D8 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ankrd35E9Q9D8 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ankrd35E9Q9D8 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ankrd35E9Q9D8 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ankrd35E9Q9D8 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ankrd35E9Q9D8 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ankrd35E9Q9D8 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ankrd35E9Q9D8 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ankrd35E9Q9D8 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ankrd35E9Q9D8 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Ankrd35E9Q9D8 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ankrd35E9Q9D8 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ankrd35E9Q9D8 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ankrd35E9Q9D8 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ankrd35E9Q9D8 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ankrd35E9Q9D8 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Ankrd35E9Q9D8 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ankrd35E9Q9D8 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ankrd35E9Q9D8 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ankrd35E9Q9D8 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ankrd35E9Q9D8 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ankrd35E9Q9D8 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Ankrd35E9Q9D8 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ankrd35E9Q9D8 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Ankrd35E9Q9D8 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ankrd35E9Q9D8 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ankrd35E9Q9D8 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ankrd35E9Q9D8 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ankrd35E9Q9D8 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ankrd35E9Q9D8 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ankrd35E9Q9D8 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ankrd35E9Q9D8 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ankrd35E9Q9D8 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ankrd35E9Q9D8 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ankrd35E9Q9D8 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ankrd35E9Q9D8 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Ankrd35E9Q9D8 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ankrd35E9Q9D8 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ankrd35E9Q9D8 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ankrd35E9Q9D8 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Ankrd35E9Q9D8 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ankrd35E9Q9D8 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Ankrd35E9Q9D8 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ankrd35E9Q9D8 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ankrd35E9Q9D8 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ankrd35E9Q9D8 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ankrd35E9Q9D8 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ankrd35E9Q9D8 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ankrd35E9Q9D8 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ankrd35E9Q9D8 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ankrd35E9Q9D8 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ankrd35E9Q9D8 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ankrd35E9Q9D8 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms