Protein–RNA interactions for Protein: E9Q7L1

Urb2, URB2 ribosome biogenesis 2 homolog (S. cerevisiae), mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,524 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Urb2E9Q7L1 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Urb2E9Q7L1 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Urb2E9Q7L1 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Urb2E9Q7L1 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Urb2E9Q7L1 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Urb2E9Q7L1 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Urb2E9Q7L1 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Urb2E9Q7L1 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Urb2E9Q7L1 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Urb2E9Q7L1 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Urb2E9Q7L1 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Urb2E9Q7L1 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Urb2E9Q7L1 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Urb2E9Q7L1 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Urb2E9Q7L1 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Urb2E9Q7L1 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Urb2E9Q7L1 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Urb2E9Q7L1 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Urb2E9Q7L1 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Urb2E9Q7L1 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Urb2E9Q7L1 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Urb2E9Q7L1 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Urb2E9Q7L1 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Urb2E9Q7L1 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Urb2E9Q7L1 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Urb2E9Q7L1 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Urb2E9Q7L1 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Urb2E9Q7L1 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Urb2E9Q7L1 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Urb2E9Q7L1 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Urb2E9Q7L1 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Urb2E9Q7L1 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Urb2E9Q7L1 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Urb2E9Q7L1 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Urb2E9Q7L1 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Urb2E9Q7L1 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Urb2E9Q7L1 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Urb2E9Q7L1 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Urb2E9Q7L1 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Urb2E9Q7L1 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Urb2E9Q7L1 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Urb2E9Q7L1 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Urb2E9Q7L1 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Urb2E9Q7L1 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Urb2E9Q7L1 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Urb2E9Q7L1 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Urb2E9Q7L1 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Urb2E9Q7L1 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Urb2E9Q7L1 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Urb2E9Q7L1 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Urb2E9Q7L1 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Urb2E9Q7L1 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Urb2E9Q7L1 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Urb2E9Q7L1 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Urb2E9Q7L1 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Urb2E9Q7L1 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Urb2E9Q7L1 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Urb2E9Q7L1 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Urb2E9Q7L1 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Urb2E9Q7L1 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Urb2E9Q7L1 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Urb2E9Q7L1 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Urb2E9Q7L1 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Urb2E9Q7L1 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Urb2E9Q7L1 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Urb2E9Q7L1 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Urb2E9Q7L1 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Urb2E9Q7L1 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Urb2E9Q7L1 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Urb2E9Q7L1 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Urb2E9Q7L1 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
Urb2E9Q7L1 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Urb2E9Q7L1 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Urb2E9Q7L1 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Urb2E9Q7L1 Gm18827-201ENSMUST00000188341 790 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
Urb2E9Q7L1 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
Urb2E9Q7L1 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
Urb2E9Q7L1 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Urb2E9Q7L1 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Urb2E9Q7L1 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Urb2E9Q7L1 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Urb2E9Q7L1 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Urb2E9Q7L1 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Urb2E9Q7L1 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Urb2E9Q7L1 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Urb2E9Q7L1 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Urb2E9Q7L1 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Urb2E9Q7L1 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Urb2E9Q7L1 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Urb2E9Q7L1 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Urb2E9Q7L1 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Urb2E9Q7L1 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Urb2E9Q7L1 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Urb2E9Q7L1 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Urb2E9Q7L1 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Urb2E9Q7L1 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Urb2E9Q7L1 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Urb2E9Q7L1 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Urb2E9Q7L1 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Urb2E9Q7L1 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms