Protein–RNA interactions for Protein: E9Q612

Ptpro, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase O, mousemouse

Predictions only

Length 1,226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtproE9Q612 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PtproE9Q612 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PtproE9Q612 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PtproE9Q612 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PtproE9Q612 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
PtproE9Q612 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PtproE9Q612 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PtproE9Q612 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PtproE9Q612 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PtproE9Q612 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PtproE9Q612 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PtproE9Q612 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PtproE9Q612 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PtproE9Q612 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PtproE9Q612 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PtproE9Q612 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
PtproE9Q612 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PtproE9Q612 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
PtproE9Q612 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
PtproE9Q612 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
PtproE9Q612 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
PtproE9Q612 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PtproE9Q612 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PtproE9Q612 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PtproE9Q612 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PtproE9Q612 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PtproE9Q612 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PtproE9Q612 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PtproE9Q612 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PtproE9Q612 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PtproE9Q612 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PtproE9Q612 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PtproE9Q612 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PtproE9Q612 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PtproE9Q612 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PtproE9Q612 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PtproE9Q612 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PtproE9Q612 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PtproE9Q612 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PtproE9Q612 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PtproE9Q612 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PtproE9Q612 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PtproE9Q612 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PtproE9Q612 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PtproE9Q612 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PtproE9Q612 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PtproE9Q612 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PtproE9Q612 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PtproE9Q612 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PtproE9Q612 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PtproE9Q612 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PtproE9Q612 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PtproE9Q612 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PtproE9Q612 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PtproE9Q612 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PtproE9Q612 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PtproE9Q612 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PtproE9Q612 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PtproE9Q612 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PtproE9Q612 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PtproE9Q612 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PtproE9Q612 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PtproE9Q612 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PtproE9Q612 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PtproE9Q612 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PtproE9Q612 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PtproE9Q612 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PtproE9Q612 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PtproE9Q612 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PtproE9Q612 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PtproE9Q612 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PtproE9Q612 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PtproE9Q612 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PtproE9Q612 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PtproE9Q612 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PtproE9Q612 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PtproE9Q612 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PtproE9Q612 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PtproE9Q612 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PtproE9Q612 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PtproE9Q612 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PtproE9Q612 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PtproE9Q612 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
PtproE9Q612 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PtproE9Q612 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PtproE9Q612 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
PtproE9Q612 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PtproE9Q612 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PtproE9Q612 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PtproE9Q612 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PtproE9Q612 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PtproE9Q612 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PtproE9Q612 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PtproE9Q612 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PtproE9Q612 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PtproE9Q612 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PtproE9Q612 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PtproE9Q612 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
PtproE9Q612 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
PtproE9Q612 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms