Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1T6

Lrp3, Low density lipoprotein receptor-related protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 790 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrp3E9Q1T6 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Lrp3E9Q1T6 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Lrp3E9Q1T6 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Lrp3E9Q1T6 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Lrp3E9Q1T6 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Lrp3E9Q1T6 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Lrp3E9Q1T6 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Lrp3E9Q1T6 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Lrp3E9Q1T6 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Lrp3E9Q1T6 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Lrp3E9Q1T6 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Lrp3E9Q1T6 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Lrp3E9Q1T6 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Lrp3E9Q1T6 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Lrp3E9Q1T6 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Lrp3E9Q1T6 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Lrp3E9Q1T6 Gm25349-201ENSMUST00000177728 110 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Lrp3E9Q1T6 Gm23616-201ENSMUST00000177797 110 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Lrp3E9Q1T6 Gm25871-201ENSMUST00000177816 110 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Lrp3E9Q1T6 Gm24752-201ENSMUST00000178240 110 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Lrp3E9Q1T6 Gm24496-201ENSMUST00000178287 110 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Lrp3E9Q1T6 Gm25649-201ENSMUST00000178476 110 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Lrp3E9Q1T6 Gm25548-201ENSMUST00000178681 110 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Lrp3E9Q1T6 Gm23147-201ENSMUST00000178841 110 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Lrp3E9Q1T6 Gm26095-201ENSMUST00000179270 110 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Lrp3E9Q1T6 Gm22171-201ENSMUST00000179283 110 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Lrp3E9Q1T6 Gm23936-201ENSMUST00000179354 110 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Lrp3E9Q1T6 Gm22619-201ENSMUST00000179516 110 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Lrp3E9Q1T6 Gm25255-201ENSMUST00000179579 110 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Lrp3E9Q1T6 Gm24755-201ENSMUST00000179691 110 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Lrp3E9Q1T6 Gm26506-201ENSMUST00000179692 110 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Lrp3E9Q1T6 Gm25086-201ENSMUST00000179931 110 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Lrp3E9Q1T6 Gm23243-201ENSMUST00000180047 110 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Lrp3E9Q1T6 Gm24659-201ENSMUST00000180212 110 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Lrp3E9Q1T6 Gm24169-201ENSMUST00000180244 110 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Lrp3E9Q1T6 Gm23689-201ENSMUST00000180354 110 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Lrp3E9Q1T6 Gm27359-201ENSMUST00000184153 110 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Lrp3E9Q1T6 Gm27785-201ENSMUST00000184268 110 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Lrp3E9Q1T6 Gm27466-201ENSMUST00000184396 110 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Lrp3E9Q1T6 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Lrp3E9Q1T6 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Lrp3E9Q1T6 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Lrp3E9Q1T6 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Lrp3E9Q1T6 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Lrp3E9Q1T6 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Lrp3E9Q1T6 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Lrp3E9Q1T6 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Lrp3E9Q1T6 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Lrp3E9Q1T6 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Lrp3E9Q1T6 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Lrp3E9Q1T6 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Lrp3E9Q1T6 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Lrp3E9Q1T6 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Lrp3E9Q1T6 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Lrp3E9Q1T6 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Lrp3E9Q1T6 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Lrp3E9Q1T6 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Lrp3E9Q1T6 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Lrp3E9Q1T6 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Lrp3E9Q1T6 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Lrp3E9Q1T6 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Lrp3E9Q1T6 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Lrp3E9Q1T6 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Lrp3E9Q1T6 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Lrp3E9Q1T6 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Lrp3E9Q1T6 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Lrp3E9Q1T6 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Lrp3E9Q1T6 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Lrp3E9Q1T6 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Lrp3E9Q1T6 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Lrp3E9Q1T6 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Lrp3E9Q1T6 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Lrp3E9Q1T6 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Lrp3E9Q1T6 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Lrp3E9Q1T6 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Lrp3E9Q1T6 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Lrp3E9Q1T6 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Lrp3E9Q1T6 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Lrp3E9Q1T6 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Lrp3E9Q1T6 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Lrp3E9Q1T6 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Lrp3E9Q1T6 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Lrp3E9Q1T6 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Lrp3E9Q1T6 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Lrp3E9Q1T6 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Lrp3E9Q1T6 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Lrp3E9Q1T6 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Lrp3E9Q1T6 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Lrp3E9Q1T6 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Lrp3E9Q1T6 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Lrp3E9Q1T6 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Lrp3E9Q1T6 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Lrp3E9Q1T6 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Lrp3E9Q1T6 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Lrp3E9Q1T6 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Lrp3E9Q1T6 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Lrp3E9Q1T6 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Lrp3E9Q1T6 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Lrp3E9Q1T6 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Lrp3E9Q1T6 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms