Protein–RNA interactions for Protein: E9Q0B4

Cdr1, Cerebellar degeneration-related antigen 1, mousemouse

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdr1E9Q0B4 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cdr1E9Q0B4 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cdr1E9Q0B4 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cdr1E9Q0B4 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cdr1E9Q0B4 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cdr1E9Q0B4 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cdr1E9Q0B4 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cdr1E9Q0B4 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cdr1E9Q0B4 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cdr1E9Q0B4 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cdr1E9Q0B4 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cdr1E9Q0B4 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cdr1E9Q0B4 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cdr1E9Q0B4 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cdr1E9Q0B4 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cdr1E9Q0B4 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cdr1E9Q0B4 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cdr1E9Q0B4 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cdr1E9Q0B4 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cdr1E9Q0B4 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cdr1E9Q0B4 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cdr1E9Q0B4 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cdr1E9Q0B4 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cdr1E9Q0B4 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cdr1E9Q0B4 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cdr1E9Q0B4 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cdr1E9Q0B4 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cdr1E9Q0B4 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cdr1E9Q0B4 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Cdr1E9Q0B4 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cdr1E9Q0B4 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cdr1E9Q0B4 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cdr1E9Q0B4 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cdr1E9Q0B4 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cdr1E9Q0B4 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Cdr1E9Q0B4 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cdr1E9Q0B4 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cdr1E9Q0B4 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cdr1E9Q0B4 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cdr1E9Q0B4 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cdr1E9Q0B4 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cdr1E9Q0B4 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cdr1E9Q0B4 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cdr1E9Q0B4 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cdr1E9Q0B4 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cdr1E9Q0B4 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cdr1E9Q0B4 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cdr1E9Q0B4 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cdr1E9Q0B4 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cdr1E9Q0B4 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cdr1E9Q0B4 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cdr1E9Q0B4 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cdr1E9Q0B4 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cdr1E9Q0B4 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cdr1E9Q0B4 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cdr1E9Q0B4 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cdr1E9Q0B4 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cdr1E9Q0B4 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cdr1E9Q0B4 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cdr1E9Q0B4 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cdr1E9Q0B4 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cdr1E9Q0B4 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cdr1E9Q0B4 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cdr1E9Q0B4 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cdr1E9Q0B4 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cdr1E9Q0B4 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cdr1E9Q0B4 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cdr1E9Q0B4 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cdr1E9Q0B4 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cdr1E9Q0B4 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cdr1E9Q0B4 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cdr1E9Q0B4 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cdr1E9Q0B4 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cdr1E9Q0B4 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cdr1E9Q0B4 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cdr1E9Q0B4 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cdr1E9Q0B4 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cdr1E9Q0B4 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cdr1E9Q0B4 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cdr1E9Q0B4 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cdr1E9Q0B4 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cdr1E9Q0B4 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cdr1E9Q0B4 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cdr1E9Q0B4 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cdr1E9Q0B4 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cdr1E9Q0B4 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cdr1E9Q0B4 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cdr1E9Q0B4 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cdr1E9Q0B4 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cdr1E9Q0B4 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cdr1E9Q0B4 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cdr1E9Q0B4 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cdr1E9Q0B4 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cdr1E9Q0B4 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cdr1E9Q0B4 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Cdr1E9Q0B4 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cdr1E9Q0B4 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cdr1E9Q0B4 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cdr1E9Q0B4 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cdr1E9Q0B4 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms