Protein–RNA interactions for Protein: E9Q035

Gm20425, Predicted gene 20425, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 978 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20425E9Q035 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm20425E9Q035 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm20425E9Q035 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm20425E9Q035 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm20425E9Q035 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm20425E9Q035 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm20425E9Q035 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm20425E9Q035 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm20425E9Q035 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm20425E9Q035 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm20425E9Q035 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm20425E9Q035 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm20425E9Q035 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm20425E9Q035 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm20425E9Q035 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm20425E9Q035 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm20425E9Q035 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm20425E9Q035 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm20425E9Q035 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm20425E9Q035 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm20425E9Q035 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm20425E9Q035 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm20425E9Q035 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm20425E9Q035 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm20425E9Q035 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm20425E9Q035 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Gm20425E9Q035 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Gm20425E9Q035 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Gm20425E9Q035 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Gm20425E9Q035 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm20425E9Q035 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm20425E9Q035 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm20425E9Q035 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm20425E9Q035 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm20425E9Q035 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm20425E9Q035 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm20425E9Q035 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm20425E9Q035 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm20425E9Q035 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm20425E9Q035 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm20425E9Q035 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm20425E9Q035 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm20425E9Q035 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm20425E9Q035 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm20425E9Q035 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm20425E9Q035 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm20425E9Q035 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm20425E9Q035 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm20425E9Q035 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm20425E9Q035 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm20425E9Q035 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm20425E9Q035 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm20425E9Q035 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm20425E9Q035 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm20425E9Q035 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm20425E9Q035 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm20425E9Q035 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm20425E9Q035 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm20425E9Q035 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm20425E9Q035 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm20425E9Q035 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm20425E9Q035 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm20425E9Q035 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm20425E9Q035 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm20425E9Q035 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm20425E9Q035 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm20425E9Q035 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm20425E9Q035 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm20425E9Q035 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm20425E9Q035 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm20425E9Q035 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm20425E9Q035 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm20425E9Q035 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm20425E9Q035 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm20425E9Q035 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm20425E9Q035 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm20425E9Q035 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm20425E9Q035 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm20425E9Q035 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm20425E9Q035 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm20425E9Q035 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm20425E9Q035 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm20425E9Q035 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm20425E9Q035 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm20425E9Q035 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm20425E9Q035 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm20425E9Q035 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm20425E9Q035 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm20425E9Q035 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm20425E9Q035 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm20425E9Q035 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm20425E9Q035 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm20425E9Q035 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm20425E9Q035 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm20425E9Q035 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm20425E9Q035 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm20425E9Q035 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm20425E9Q035 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm20425E9Q035 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm20425E9Q035 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms