Protein–RNA interactions for Protein: E9PZQ0

Ryr1, Ryanodine receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 5,035 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ryr1E9PZQ0 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ryr1E9PZQ0 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ryr1E9PZQ0 Trpm2-201ENSMUST00000105399 731 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ryr1E9PZQ0 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ryr1E9PZQ0 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ryr1E9PZQ0 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ryr1E9PZQ0 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Ryr1E9PZQ0 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Ryr1E9PZQ0 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ryr1E9PZQ0 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ryr1E9PZQ0 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ryr1E9PZQ0 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Ryr1E9PZQ0 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
Ryr1E9PZQ0 Fam118b-202ENSMUST00000063782 1662 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Ryr1E9PZQ0 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Ryr1E9PZQ0 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Ryr1E9PZQ0 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Ryr1E9PZQ0 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Ryr1E9PZQ0 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Ryr1E9PZQ0 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Ryr1E9PZQ0 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Ryr1E9PZQ0 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Ryr1E9PZQ0 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Ryr1E9PZQ0 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Ryr1E9PZQ0 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Ryr1E9PZQ0 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Ryr1E9PZQ0 Tpm1-210ENSMUST00000113693 1054 ntTSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Ryr1E9PZQ0 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Ryr1E9PZQ0 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Ryr1E9PZQ0 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Ryr1E9PZQ0 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Ryr1E9PZQ0 Bloc1s2-ps-201ENSMUST00000183232 432 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
Ryr1E9PZQ0 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Ryr1E9PZQ0 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Ryr1E9PZQ0 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
Ryr1E9PZQ0 Treml1-205ENSMUST00000225849 974 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Ryr1E9PZQ0 Gm25517-201ENSMUST00000083865 134 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
Ryr1E9PZQ0 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Ryr1E9PZQ0 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Ryr1E9PZQ0 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Ryr1E9PZQ0 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Ryr1E9PZQ0 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Ryr1E9PZQ0 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Ryr1E9PZQ0 Coa3-202ENSMUST00000168089 291 ntTSL 3 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Ryr1E9PZQ0 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
Ryr1E9PZQ0 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Ryr1E9PZQ0 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Ryr1E9PZQ0 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Ryr1E9PZQ0 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Ryr1E9PZQ0 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Ryr1E9PZQ0 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Ryr1E9PZQ0 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Ryr1E9PZQ0 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Ryr1E9PZQ0 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Ryr1E9PZQ0 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Ryr1E9PZQ0 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Ryr1E9PZQ0 Gm14017-201ENSMUST00000121934 386 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
Ryr1E9PZQ0 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Ryr1E9PZQ0 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
Ryr1E9PZQ0 Gm40652-201ENSMUST00000218944 895 ntTSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Ryr1E9PZQ0 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Ryr1E9PZQ0 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Ryr1E9PZQ0 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Ryr1E9PZQ0 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Ryr1E9PZQ0 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Ryr1E9PZQ0 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Ryr1E9PZQ0 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Ryr1E9PZQ0 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Ryr1E9PZQ0 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Ryr1E9PZQ0 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Ryr1E9PZQ0 Arhgef33-210ENSMUST00000225548 456 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
Ryr1E9PZQ0 Tnni3-201ENSMUST00000098859 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Ryr1E9PZQ0 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Ryr1E9PZQ0 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Ryr1E9PZQ0 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Ryr1E9PZQ0 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Ryr1E9PZQ0 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Ryr1E9PZQ0 Gm11675-201ENSMUST00000121873 832 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
Ryr1E9PZQ0 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
Ryr1E9PZQ0 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Ryr1E9PZQ0 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Ryr1E9PZQ0 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Ryr1E9PZQ0 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Ryr1E9PZQ0 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
Ryr1E9PZQ0 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Ryr1E9PZQ0 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Ryr1E9PZQ0 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Ryr1E9PZQ0 Gm12616-201ENSMUST00000118594 382 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
Ryr1E9PZQ0 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Ryr1E9PZQ0 Gm12624-201ENSMUST00000177615 382 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
Ryr1E9PZQ0 Gm12621-201ENSMUST00000177760 382 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
Ryr1E9PZQ0 Gm12615-201ENSMUST00000177970 382 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
Ryr1E9PZQ0 Gm12622-201ENSMUST00000177975 382 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
Ryr1E9PZQ0 Gm12627-201ENSMUST00000178412 382 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
Ryr1E9PZQ0 Gm12625-201ENSMUST00000179122 382 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
Ryr1E9PZQ0 Gm12614-201ENSMUST00000179586 382 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
Ryr1E9PZQ0 Gm12613-201ENSMUST00000180323 382 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
Ryr1E9PZQ0 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Ryr1E9PZQ0 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Ryr1E9PZQ0 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65 ms