Protein–RNA interactions for Protein: E9PXF8

Sbf2, SET-binding factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,872 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sbf2E9PXF8 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sbf2E9PXF8 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sbf2E9PXF8 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sbf2E9PXF8 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sbf2E9PXF8 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sbf2E9PXF8 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sbf2E9PXF8 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sbf2E9PXF8 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sbf2E9PXF8 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sbf2E9PXF8 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sbf2E9PXF8 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sbf2E9PXF8 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sbf2E9PXF8 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sbf2E9PXF8 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sbf2E9PXF8 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sbf2E9PXF8 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sbf2E9PXF8 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sbf2E9PXF8 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sbf2E9PXF8 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sbf2E9PXF8 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sbf2E9PXF8 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sbf2E9PXF8 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sbf2E9PXF8 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sbf2E9PXF8 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sbf2E9PXF8 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Sbf2E9PXF8 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sbf2E9PXF8 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sbf2E9PXF8 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sbf2E9PXF8 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sbf2E9PXF8 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sbf2E9PXF8 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sbf2E9PXF8 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sbf2E9PXF8 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sbf2E9PXF8 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sbf2E9PXF8 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sbf2E9PXF8 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sbf2E9PXF8 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sbf2E9PXF8 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sbf2E9PXF8 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sbf2E9PXF8 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sbf2E9PXF8 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sbf2E9PXF8 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sbf2E9PXF8 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sbf2E9PXF8 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sbf2E9PXF8 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sbf2E9PXF8 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sbf2E9PXF8 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sbf2E9PXF8 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sbf2E9PXF8 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sbf2E9PXF8 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Sbf2E9PXF8 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sbf2E9PXF8 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sbf2E9PXF8 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Sbf2E9PXF8 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sbf2E9PXF8 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sbf2E9PXF8 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sbf2E9PXF8 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sbf2E9PXF8 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sbf2E9PXF8 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Sbf2E9PXF8 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Sbf2E9PXF8 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sbf2E9PXF8 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sbf2E9PXF8 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sbf2E9PXF8 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sbf2E9PXF8 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sbf2E9PXF8 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sbf2E9PXF8 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sbf2E9PXF8 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sbf2E9PXF8 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sbf2E9PXF8 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sbf2E9PXF8 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sbf2E9PXF8 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sbf2E9PXF8 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sbf2E9PXF8 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sbf2E9PXF8 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sbf2E9PXF8 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sbf2E9PXF8 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Sbf2E9PXF8 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sbf2E9PXF8 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Sbf2E9PXF8 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sbf2E9PXF8 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Sbf2E9PXF8 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sbf2E9PXF8 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sbf2E9PXF8 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sbf2E9PXF8 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Sbf2E9PXF8 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sbf2E9PXF8 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sbf2E9PXF8 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sbf2E9PXF8 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sbf2E9PXF8 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sbf2E9PXF8 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sbf2E9PXF8 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sbf2E9PXF8 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sbf2E9PXF8 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sbf2E9PXF8 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sbf2E9PXF8 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sbf2E9PXF8 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sbf2E9PXF8 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sbf2E9PXF8 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sbf2E9PXF8 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms