Protein–RNA interactions for Protein: E9PWQ3

Col6a3, Collagen, type VI, alpha 3, mousemouse

Predictions only

Length 3,284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col6a3E9PWQ3 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Col6a3E9PWQ3 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Col6a3E9PWQ3 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Col6a3E9PWQ3 Gm9445-201ENSMUST00000207454 1285 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Col6a3E9PWQ3 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Col6a3E9PWQ3 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Col6a3E9PWQ3 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Col6a3E9PWQ3 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Col6a3E9PWQ3 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Col6a3E9PWQ3 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Col6a3E9PWQ3 Ptges3l-203ENSMUST00000107252 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Col6a3E9PWQ3 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Col6a3E9PWQ3 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Col6a3E9PWQ3 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Col6a3E9PWQ3 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Col6a3E9PWQ3 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Col6a3E9PWQ3 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Col6a3E9PWQ3 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Col6a3E9PWQ3 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Col6a3E9PWQ3 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Col6a3E9PWQ3 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Col6a3E9PWQ3 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Col6a3E9PWQ3 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Col6a3E9PWQ3 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Col6a3E9PWQ3 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Col6a3E9PWQ3 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Col6a3E9PWQ3 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Col6a3E9PWQ3 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Col6a3E9PWQ3 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Col6a3E9PWQ3 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Col6a3E9PWQ3 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Col6a3E9PWQ3 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Col6a3E9PWQ3 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Col6a3E9PWQ3 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Col6a3E9PWQ3 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Col6a3E9PWQ3 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Col6a3E9PWQ3 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Col6a3E9PWQ3 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Col6a3E9PWQ3 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Col6a3E9PWQ3 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Col6a3E9PWQ3 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Col6a3E9PWQ3 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Col6a3E9PWQ3 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Col6a3E9PWQ3 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Col6a3E9PWQ3 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Col6a3E9PWQ3 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Col6a3E9PWQ3 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Col6a3E9PWQ3 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Col6a3E9PWQ3 Mocs2-203ENSMUST00000164737 745 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Col6a3E9PWQ3 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Col6a3E9PWQ3 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Col6a3E9PWQ3 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Col6a3E9PWQ3 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Col6a3E9PWQ3 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Col6a3E9PWQ3 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Col6a3E9PWQ3 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Col6a3E9PWQ3 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Col6a3E9PWQ3 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Col6a3E9PWQ3 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Col6a3E9PWQ3 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Col6a3E9PWQ3 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Col6a3E9PWQ3 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Col6a3E9PWQ3 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Col6a3E9PWQ3 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Col6a3E9PWQ3 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Col6a3E9PWQ3 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Col6a3E9PWQ3 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Col6a3E9PWQ3 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Col6a3E9PWQ3 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Col6a3E9PWQ3 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Col6a3E9PWQ3 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Col6a3E9PWQ3 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Col6a3E9PWQ3 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Col6a3E9PWQ3 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Col6a3E9PWQ3 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Col6a3E9PWQ3 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Col6a3E9PWQ3 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Col6a3E9PWQ3 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Col6a3E9PWQ3 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Col6a3E9PWQ3 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Col6a3E9PWQ3 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Col6a3E9PWQ3 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Col6a3E9PWQ3 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Col6a3E9PWQ3 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Col6a3E9PWQ3 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Col6a3E9PWQ3 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Col6a3E9PWQ3 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Col6a3E9PWQ3 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Col6a3E9PWQ3 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Col6a3E9PWQ3 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Col6a3E9PWQ3 Gm11290-203ENSMUST00000147811 314 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Col6a3E9PWQ3 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Col6a3E9PWQ3 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Col6a3E9PWQ3 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Col6a3E9PWQ3 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Col6a3E9PWQ3 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Col6a3E9PWQ3 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Col6a3E9PWQ3 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Col6a3E9PWQ3 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Col6a3E9PWQ3 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms