Protein–RNA interactions for Protein: E9PVB5

Ttc17, Tetratricopeptide repeat protein 17, mousemouse

Predictions only

Length 1,198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc17E9PVB5 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ttc17E9PVB5 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Ttc17E9PVB5 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ttc17E9PVB5 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ttc17E9PVB5 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Ttc17E9PVB5 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ttc17E9PVB5 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ttc17E9PVB5 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Ttc17E9PVB5 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ttc17E9PVB5 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ttc17E9PVB5 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ttc17E9PVB5 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ttc17E9PVB5 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ttc17E9PVB5 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ttc17E9PVB5 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ttc17E9PVB5 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ttc17E9PVB5 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ttc17E9PVB5 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ttc17E9PVB5 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ttc17E9PVB5 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ttc17E9PVB5 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ttc17E9PVB5 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ttc17E9PVB5 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Ttc17E9PVB5 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ttc17E9PVB5 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ttc17E9PVB5 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ttc17E9PVB5 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ttc17E9PVB5 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ttc17E9PVB5 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ttc17E9PVB5 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ttc17E9PVB5 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Ttc17E9PVB5 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ttc17E9PVB5 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ttc17E9PVB5 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Ttc17E9PVB5 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ttc17E9PVB5 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ttc17E9PVB5 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ttc17E9PVB5 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ttc17E9PVB5 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ttc17E9PVB5 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ttc17E9PVB5 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ttc17E9PVB5 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ttc17E9PVB5 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ttc17E9PVB5 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ttc17E9PVB5 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ttc17E9PVB5 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ttc17E9PVB5 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ttc17E9PVB5 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ttc17E9PVB5 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ttc17E9PVB5 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Ttc17E9PVB5 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ttc17E9PVB5 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ttc17E9PVB5 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Ttc17E9PVB5 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ttc17E9PVB5 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ttc17E9PVB5 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ttc17E9PVB5 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ttc17E9PVB5 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ttc17E9PVB5 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ttc17E9PVB5 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ttc17E9PVB5 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ttc17E9PVB5 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ttc17E9PVB5 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ttc17E9PVB5 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ttc17E9PVB5 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Ttc17E9PVB5 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ttc17E9PVB5 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ttc17E9PVB5 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ttc17E9PVB5 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ttc17E9PVB5 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ttc17E9PVB5 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ttc17E9PVB5 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ttc17E9PVB5 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ttc17E9PVB5 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ttc17E9PVB5 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Ttc17E9PVB5 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ttc17E9PVB5 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ttc17E9PVB5 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ttc17E9PVB5 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ttc17E9PVB5 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ttc17E9PVB5 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ttc17E9PVB5 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ttc17E9PVB5 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ttc17E9PVB5 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ttc17E9PVB5 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ttc17E9PVB5 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ttc17E9PVB5 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ttc17E9PVB5 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ttc17E9PVB5 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ttc17E9PVB5 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Ttc17E9PVB5 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ttc17E9PVB5 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ttc17E9PVB5 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ttc17E9PVB5 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ttc17E9PVB5 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Ttc17E9PVB5 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ttc17E9PVB5 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Ttc17E9PVB5 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Ttc17E9PVB5 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Ttc17E9PVB5 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms