Protein–RNA interactions for Protein: E1U8D0

Soga1, Protein SOGA1, mousemouse

Predictions only

Length 1,418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Soga1E1U8D0 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Soga1E1U8D0 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Soga1E1U8D0 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Soga1E1U8D0 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Soga1E1U8D0 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Soga1E1U8D0 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Soga1E1U8D0 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Soga1E1U8D0 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Soga1E1U8D0 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Soga1E1U8D0 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Soga1E1U8D0 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Soga1E1U8D0 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Soga1E1U8D0 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Soga1E1U8D0 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Soga1E1U8D0 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Soga1E1U8D0 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Soga1E1U8D0 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Soga1E1U8D0 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Soga1E1U8D0 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Soga1E1U8D0 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Soga1E1U8D0 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Soga1E1U8D0 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Soga1E1U8D0 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Soga1E1U8D0 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Soga1E1U8D0 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Soga1E1U8D0 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Soga1E1U8D0 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Soga1E1U8D0 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Soga1E1U8D0 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Soga1E1U8D0 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Soga1E1U8D0 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Soga1E1U8D0 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Soga1E1U8D0 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Soga1E1U8D0 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Soga1E1U8D0 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Soga1E1U8D0 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Soga1E1U8D0 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Soga1E1U8D0 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Soga1E1U8D0 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Soga1E1U8D0 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Soga1E1U8D0 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Soga1E1U8D0 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Soga1E1U8D0 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Soga1E1U8D0 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Soga1E1U8D0 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Soga1E1U8D0 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Soga1E1U8D0 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Soga1E1U8D0 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Soga1E1U8D0 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Soga1E1U8D0 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Soga1E1U8D0 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Soga1E1U8D0 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Soga1E1U8D0 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Soga1E1U8D0 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Soga1E1U8D0 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Soga1E1U8D0 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Soga1E1U8D0 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Soga1E1U8D0 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Soga1E1U8D0 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Soga1E1U8D0 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Soga1E1U8D0 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Soga1E1U8D0 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Soga1E1U8D0 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Soga1E1U8D0 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Soga1E1U8D0 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Soga1E1U8D0 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Soga1E1U8D0 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Soga1E1U8D0 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Soga1E1U8D0 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Soga1E1U8D0 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Soga1E1U8D0 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Soga1E1U8D0 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Soga1E1U8D0 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Soga1E1U8D0 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Soga1E1U8D0 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Soga1E1U8D0 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Soga1E1U8D0 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Soga1E1U8D0 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Soga1E1U8D0 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
Soga1E1U8D0 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Soga1E1U8D0 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Soga1E1U8D0 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Soga1E1U8D0 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
Soga1E1U8D0 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Soga1E1U8D0 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Soga1E1U8D0 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Soga1E1U8D0 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Soga1E1U8D0 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Soga1E1U8D0 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Soga1E1U8D0 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Soga1E1U8D0 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Soga1E1U8D0 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Soga1E1U8D0 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Soga1E1U8D0 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Soga1E1U8D0 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Soga1E1U8D0 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Soga1E1U8D0 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Soga1E1U8D0 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Soga1E1U8D0 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Soga1E1U8D0 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms