Protein–RNA interactions for Protein: D3Z5W0

Atp6ap1l, ATPase, H+-transporting, lysosomal accessory protein 1-like, mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atp6ap1lD3Z5W0 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atp6ap1lD3Z5W0 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atp6ap1lD3Z5W0 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atp6ap1lD3Z5W0 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atp6ap1lD3Z5W0 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atp6ap1lD3Z5W0 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atp6ap1lD3Z5W0 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Atp6ap1lD3Z5W0 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atp6ap1lD3Z5W0 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atp6ap1lD3Z5W0 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atp6ap1lD3Z5W0 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atp6ap1lD3Z5W0 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atp6ap1lD3Z5W0 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atp6ap1lD3Z5W0 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atp6ap1lD3Z5W0 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atp6ap1lD3Z5W0 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atp6ap1lD3Z5W0 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atp6ap1lD3Z5W0 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atp6ap1lD3Z5W0 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atp6ap1lD3Z5W0 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atp6ap1lD3Z5W0 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atp6ap1lD3Z5W0 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atp6ap1lD3Z5W0 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atp6ap1lD3Z5W0 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atp6ap1lD3Z5W0 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atp6ap1lD3Z5W0 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atp6ap1lD3Z5W0 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atp6ap1lD3Z5W0 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atp6ap1lD3Z5W0 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atp6ap1lD3Z5W0 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atp6ap1lD3Z5W0 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atp6ap1lD3Z5W0 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atp6ap1lD3Z5W0 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atp6ap1lD3Z5W0 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atp6ap1lD3Z5W0 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atp6ap1lD3Z5W0 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atp6ap1lD3Z5W0 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atp6ap1lD3Z5W0 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atp6ap1lD3Z5W0 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atp6ap1lD3Z5W0 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atp6ap1lD3Z5W0 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atp6ap1lD3Z5W0 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atp6ap1lD3Z5W0 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atp6ap1lD3Z5W0 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atp6ap1lD3Z5W0 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atp6ap1lD3Z5W0 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atp6ap1lD3Z5W0 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atp6ap1lD3Z5W0 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atp6ap1lD3Z5W0 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atp6ap1lD3Z5W0 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atp6ap1lD3Z5W0 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atp6ap1lD3Z5W0 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Atp6ap1lD3Z5W0 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atp6ap1lD3Z5W0 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atp6ap1lD3Z5W0 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Atp6ap1lD3Z5W0 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atp6ap1lD3Z5W0 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atp6ap1lD3Z5W0 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atp6ap1lD3Z5W0 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atp6ap1lD3Z5W0 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Atp6ap1lD3Z5W0 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atp6ap1lD3Z5W0 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atp6ap1lD3Z5W0 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atp6ap1lD3Z5W0 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atp6ap1lD3Z5W0 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atp6ap1lD3Z5W0 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atp6ap1lD3Z5W0 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atp6ap1lD3Z5W0 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atp6ap1lD3Z5W0 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atp6ap1lD3Z5W0 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atp6ap1lD3Z5W0 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atp6ap1lD3Z5W0 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atp6ap1lD3Z5W0 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atp6ap1lD3Z5W0 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Atp6ap1lD3Z5W0 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Atp6ap1lD3Z5W0 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atp6ap1lD3Z5W0 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atp6ap1lD3Z5W0 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atp6ap1lD3Z5W0 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atp6ap1lD3Z5W0 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atp6ap1lD3Z5W0 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atp6ap1lD3Z5W0 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atp6ap1lD3Z5W0 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atp6ap1lD3Z5W0 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atp6ap1lD3Z5W0 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Atp6ap1lD3Z5W0 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atp6ap1lD3Z5W0 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.6 ms