Protein–RNA interactions for Protein: D3Z3L3

Trim12c, Tripartite motif-containing 12C, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim12cD3Z3L3 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trim12cD3Z3L3 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Trim12cD3Z3L3 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trim12cD3Z3L3 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trim12cD3Z3L3 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trim12cD3Z3L3 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trim12cD3Z3L3 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trim12cD3Z3L3 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trim12cD3Z3L3 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trim12cD3Z3L3 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trim12cD3Z3L3 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trim12cD3Z3L3 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trim12cD3Z3L3 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trim12cD3Z3L3 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Trim12cD3Z3L3 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trim12cD3Z3L3 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Trim12cD3Z3L3 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Trim12cD3Z3L3 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trim12cD3Z3L3 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trim12cD3Z3L3 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trim12cD3Z3L3 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trim12cD3Z3L3 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trim12cD3Z3L3 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trim12cD3Z3L3 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trim12cD3Z3L3 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trim12cD3Z3L3 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Trim12cD3Z3L3 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Trim12cD3Z3L3 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trim12cD3Z3L3 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trim12cD3Z3L3 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Trim12cD3Z3L3 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trim12cD3Z3L3 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trim12cD3Z3L3 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trim12cD3Z3L3 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Trim12cD3Z3L3 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trim12cD3Z3L3 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trim12cD3Z3L3 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trim12cD3Z3L3 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trim12cD3Z3L3 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trim12cD3Z3L3 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trim12cD3Z3L3 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Trim12cD3Z3L3 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trim12cD3Z3L3 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trim12cD3Z3L3 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trim12cD3Z3L3 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trim12cD3Z3L3 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trim12cD3Z3L3 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trim12cD3Z3L3 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trim12cD3Z3L3 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trim12cD3Z3L3 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trim12cD3Z3L3 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trim12cD3Z3L3 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trim12cD3Z3L3 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trim12cD3Z3L3 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trim12cD3Z3L3 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trim12cD3Z3L3 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trim12cD3Z3L3 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trim12cD3Z3L3 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trim12cD3Z3L3 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trim12cD3Z3L3 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trim12cD3Z3L3 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trim12cD3Z3L3 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Trim12cD3Z3L3 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trim12cD3Z3L3 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Trim12cD3Z3L3 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trim12cD3Z3L3 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trim12cD3Z3L3 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trim12cD3Z3L3 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trim12cD3Z3L3 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trim12cD3Z3L3 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trim12cD3Z3L3 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trim12cD3Z3L3 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trim12cD3Z3L3 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trim12cD3Z3L3 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trim12cD3Z3L3 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trim12cD3Z3L3 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trim12cD3Z3L3 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trim12cD3Z3L3 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trim12cD3Z3L3 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trim12cD3Z3L3 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trim12cD3Z3L3 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trim12cD3Z3L3 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trim12cD3Z3L3 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trim12cD3Z3L3 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trim12cD3Z3L3 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trim12cD3Z3L3 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trim12cD3Z3L3 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trim12cD3Z3L3 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trim12cD3Z3L3 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trim12cD3Z3L3 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trim12cD3Z3L3 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trim12cD3Z3L3 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trim12cD3Z3L3 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trim12cD3Z3L3 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trim12cD3Z3L3 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trim12cD3Z3L3 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trim12cD3Z3L3 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trim12cD3Z3L3 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Trim12cD3Z3L3 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Trim12cD3Z3L3 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms