Protein–RNA interactions for Protein: D3YXL0

Ccdc170, Coiled-coil domain-containing 170, mousemouse

Predictions only

Length 722 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc170D3YXL0 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc170D3YXL0 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc170D3YXL0 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc170D3YXL0 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc170D3YXL0 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc170D3YXL0 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc170D3YXL0 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc170D3YXL0 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc170D3YXL0 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc170D3YXL0 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc170D3YXL0 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ccdc170D3YXL0 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ccdc170D3YXL0 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ccdc170D3YXL0 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ccdc170D3YXL0 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ccdc170D3YXL0 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ccdc170D3YXL0 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc170D3YXL0 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc170D3YXL0 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc170D3YXL0 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc170D3YXL0 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc170D3YXL0 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc170D3YXL0 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc170D3YXL0 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc170D3YXL0 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc170D3YXL0 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc170D3YXL0 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc170D3YXL0 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc170D3YXL0 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc170D3YXL0 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc170D3YXL0 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc170D3YXL0 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc170D3YXL0 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc170D3YXL0 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc170D3YXL0 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc170D3YXL0 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc170D3YXL0 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc170D3YXL0 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc170D3YXL0 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc170D3YXL0 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc170D3YXL0 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc170D3YXL0 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc170D3YXL0 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc170D3YXL0 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc170D3YXL0 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc170D3YXL0 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc170D3YXL0 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc170D3YXL0 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc170D3YXL0 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc170D3YXL0 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc170D3YXL0 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc170D3YXL0 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc170D3YXL0 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc170D3YXL0 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc170D3YXL0 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc170D3YXL0 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc170D3YXL0 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc170D3YXL0 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc170D3YXL0 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc170D3YXL0 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc170D3YXL0 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc170D3YXL0 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc170D3YXL0 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc170D3YXL0 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc170D3YXL0 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc170D3YXL0 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc170D3YXL0 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc170D3YXL0 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc170D3YXL0 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc170D3YXL0 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc170D3YXL0 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc170D3YXL0 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc170D3YXL0 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc170D3YXL0 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc170D3YXL0 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc170D3YXL0 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc170D3YXL0 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc170D3YXL0 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc170D3YXL0 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc170D3YXL0 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc170D3YXL0 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc170D3YXL0 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc170D3YXL0 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc170D3YXL0 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc170D3YXL0 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc170D3YXL0 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc170D3YXL0 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc170D3YXL0 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc170D3YXL0 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc170D3YXL0 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc170D3YXL0 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc170D3YXL0 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc170D3YXL0 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc170D3YXL0 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc170D3YXL0 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc170D3YXL0 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc170D3YXL0 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc170D3YXL0 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc170D3YXL0 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc170D3YXL0 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms