Protein–RNA interactions for Protein: B9EJA2

Cttnbp2, Cortactin-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cttnbp2B9EJA2 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Cttnbp2B9EJA2 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Cttnbp2B9EJA2 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Cttnbp2B9EJA2 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Cttnbp2B9EJA2 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Cttnbp2B9EJA2 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Cttnbp2B9EJA2 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Cttnbp2B9EJA2 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Cttnbp2B9EJA2 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Cttnbp2B9EJA2 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Cttnbp2B9EJA2 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Cttnbp2B9EJA2 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Cttnbp2B9EJA2 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Cttnbp2B9EJA2 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Cttnbp2B9EJA2 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
Cttnbp2B9EJA2 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Cttnbp2B9EJA2 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Cttnbp2B9EJA2 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Cttnbp2B9EJA2 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Cttnbp2B9EJA2 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Cttnbp2B9EJA2 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Cttnbp2B9EJA2 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Cttnbp2B9EJA2 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Cttnbp2B9EJA2 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC25.58■■□□□ 1.68
Cttnbp2B9EJA2 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
Cttnbp2B9EJA2 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Cttnbp2B9EJA2 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Cttnbp2B9EJA2 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Cttnbp2B9EJA2 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Cttnbp2B9EJA2 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Cttnbp2B9EJA2 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Cttnbp2B9EJA2 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Cttnbp2B9EJA2 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Cttnbp2B9EJA2 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Cttnbp2B9EJA2 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Cttnbp2B9EJA2 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Cttnbp2B9EJA2 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Cttnbp2B9EJA2 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Cttnbp2B9EJA2 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Cttnbp2B9EJA2 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Cttnbp2B9EJA2 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Cttnbp2B9EJA2 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Cttnbp2B9EJA2 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Cttnbp2B9EJA2 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Cttnbp2B9EJA2 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Cttnbp2B9EJA2 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Cttnbp2B9EJA2 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Cttnbp2B9EJA2 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Cttnbp2B9EJA2 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Cttnbp2B9EJA2 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Cttnbp2B9EJA2 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Cttnbp2B9EJA2 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Cttnbp2B9EJA2 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Cttnbp2B9EJA2 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Cttnbp2B9EJA2 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Cttnbp2B9EJA2 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Cttnbp2B9EJA2 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Cttnbp2B9EJA2 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Cttnbp2B9EJA2 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Cttnbp2B9EJA2 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Cttnbp2B9EJA2 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Cttnbp2B9EJA2 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Cttnbp2B9EJA2 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Cttnbp2B9EJA2 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Cttnbp2B9EJA2 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Cttnbp2B9EJA2 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Cttnbp2B9EJA2 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Cttnbp2B9EJA2 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Cttnbp2B9EJA2 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Cttnbp2B9EJA2 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Cttnbp2B9EJA2 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Cttnbp2B9EJA2 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Cttnbp2B9EJA2 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Cttnbp2B9EJA2 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Cttnbp2B9EJA2 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Cttnbp2B9EJA2 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Cttnbp2B9EJA2 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Cttnbp2B9EJA2 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Cttnbp2B9EJA2 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Cttnbp2B9EJA2 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Cttnbp2B9EJA2 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Cttnbp2B9EJA2 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Cttnbp2B9EJA2 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Cttnbp2B9EJA2 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Cttnbp2B9EJA2 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Cttnbp2B9EJA2 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Cttnbp2B9EJA2 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Cttnbp2B9EJA2 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Cttnbp2B9EJA2 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Cttnbp2B9EJA2 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Cttnbp2B9EJA2 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Cttnbp2B9EJA2 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Cttnbp2B9EJA2 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Cttnbp2B9EJA2 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Cttnbp2B9EJA2 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Cttnbp2B9EJA2 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Cttnbp2B9EJA2 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Cttnbp2B9EJA2 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Cttnbp2B9EJA2 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Cttnbp2B9EJA2 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms