Protein–RNA interactions for Protein: B8JJN0

Gm20547, Predicted gene 20547, mousemouse

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Length 1,276 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20547B8JJN0 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm20547B8JJN0 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm20547B8JJN0 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm20547B8JJN0 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm20547B8JJN0 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm20547B8JJN0 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm20547B8JJN0 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm20547B8JJN0 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm20547B8JJN0 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm20547B8JJN0 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm20547B8JJN0 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm20547B8JJN0 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm20547B8JJN0 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm20547B8JJN0 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm20547B8JJN0 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm20547B8JJN0 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm20547B8JJN0 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm20547B8JJN0 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Gm20547B8JJN0 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Gm20547B8JJN0 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Gm20547B8JJN0 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Gm20547B8JJN0 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm20547B8JJN0 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm20547B8JJN0 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm20547B8JJN0 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm20547B8JJN0 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm20547B8JJN0 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Gm20547B8JJN0 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Gm20547B8JJN0 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm20547B8JJN0 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm20547B8JJN0 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm20547B8JJN0 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm20547B8JJN0 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm20547B8JJN0 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm20547B8JJN0 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm20547B8JJN0 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm20547B8JJN0 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm20547B8JJN0 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm20547B8JJN0 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Gm20547B8JJN0 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Gm20547B8JJN0 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm20547B8JJN0 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm20547B8JJN0 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm20547B8JJN0 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Gm20547B8JJN0 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm20547B8JJN0 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm20547B8JJN0 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm20547B8JJN0 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm20547B8JJN0 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm20547B8JJN0 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm20547B8JJN0 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm20547B8JJN0 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm20547B8JJN0 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm20547B8JJN0 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm20547B8JJN0 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm20547B8JJN0 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm20547B8JJN0 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm20547B8JJN0 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm20547B8JJN0 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm20547B8JJN0 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm20547B8JJN0 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm20547B8JJN0 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm20547B8JJN0 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm20547B8JJN0 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
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