Protein–RNA interactions for Protein: B2RVW2

Clrn2, Clarin 2, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clrn2B2RVW2 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Clrn2B2RVW2 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Clrn2B2RVW2 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Clrn2B2RVW2 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Clrn2B2RVW2 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Clrn2B2RVW2 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Clrn2B2RVW2 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Clrn2B2RVW2 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Clrn2B2RVW2 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Clrn2B2RVW2 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Clrn2B2RVW2 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Clrn2B2RVW2 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Clrn2B2RVW2 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Clrn2B2RVW2 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Clrn2B2RVW2 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Clrn2B2RVW2 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Clrn2B2RVW2 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Clrn2B2RVW2 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Clrn2B2RVW2 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Clrn2B2RVW2 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Clrn2B2RVW2 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Clrn2B2RVW2 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Clrn2B2RVW2 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Clrn2B2RVW2 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Clrn2B2RVW2 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Clrn2B2RVW2 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Clrn2B2RVW2 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Clrn2B2RVW2 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Clrn2B2RVW2 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Clrn2B2RVW2 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Clrn2B2RVW2 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Clrn2B2RVW2 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Clrn2B2RVW2 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Clrn2B2RVW2 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Clrn2B2RVW2 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Clrn2B2RVW2 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Clrn2B2RVW2 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Clrn2B2RVW2 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Clrn2B2RVW2 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Clrn2B2RVW2 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Clrn2B2RVW2 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Clrn2B2RVW2 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Clrn2B2RVW2 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Clrn2B2RVW2 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Clrn2B2RVW2 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Clrn2B2RVW2 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Clrn2B2RVW2 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Clrn2B2RVW2 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Clrn2B2RVW2 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Clrn2B2RVW2 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Clrn2B2RVW2 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Clrn2B2RVW2 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Clrn2B2RVW2 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Clrn2B2RVW2 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Clrn2B2RVW2 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Clrn2B2RVW2 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Clrn2B2RVW2 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Clrn2B2RVW2 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Clrn2B2RVW2 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Clrn2B2RVW2 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Clrn2B2RVW2 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Clrn2B2RVW2 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Clrn2B2RVW2 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Clrn2B2RVW2 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Clrn2B2RVW2 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Clrn2B2RVW2 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Clrn2B2RVW2 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Clrn2B2RVW2 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Clrn2B2RVW2 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Clrn2B2RVW2 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Clrn2B2RVW2 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Clrn2B2RVW2 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Clrn2B2RVW2 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Clrn2B2RVW2 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Clrn2B2RVW2 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Clrn2B2RVW2 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Clrn2B2RVW2 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Clrn2B2RVW2 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Clrn2B2RVW2 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Clrn2B2RVW2 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Clrn2B2RVW2 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Clrn2B2RVW2 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Clrn2B2RVW2 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Clrn2B2RVW2 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Clrn2B2RVW2 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Clrn2B2RVW2 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Clrn2B2RVW2 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Clrn2B2RVW2 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Clrn2B2RVW2 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Clrn2B2RVW2 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Clrn2B2RVW2 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Clrn2B2RVW2 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Clrn2B2RVW2 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Clrn2B2RVW2 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Clrn2B2RVW2 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Clrn2B2RVW2 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Clrn2B2RVW2 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Clrn2B2RVW2 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Clrn2B2RVW2 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Clrn2B2RVW2 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms