Protein–RNA interactions for Protein: B2RV38

Rd3l, BC048943 protein, mousemouse

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rd3lB2RV38 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rd3lB2RV38 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Rd3lB2RV38 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rd3lB2RV38 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rd3lB2RV38 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rd3lB2RV38 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rd3lB2RV38 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rd3lB2RV38 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rd3lB2RV38 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rd3lB2RV38 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rd3lB2RV38 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rd3lB2RV38 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rd3lB2RV38 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rd3lB2RV38 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rd3lB2RV38 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rd3lB2RV38 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rd3lB2RV38 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rd3lB2RV38 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rd3lB2RV38 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Rd3lB2RV38 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rd3lB2RV38 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rd3lB2RV38 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rd3lB2RV38 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rd3lB2RV38 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rd3lB2RV38 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rd3lB2RV38 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rd3lB2RV38 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Rd3lB2RV38 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rd3lB2RV38 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rd3lB2RV38 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Rd3lB2RV38 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rd3lB2RV38 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rd3lB2RV38 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rd3lB2RV38 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rd3lB2RV38 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rd3lB2RV38 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rd3lB2RV38 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rd3lB2RV38 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rd3lB2RV38 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rd3lB2RV38 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rd3lB2RV38 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rd3lB2RV38 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rd3lB2RV38 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rd3lB2RV38 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rd3lB2RV38 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rd3lB2RV38 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rd3lB2RV38 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rd3lB2RV38 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rd3lB2RV38 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rd3lB2RV38 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rd3lB2RV38 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Rd3lB2RV38 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rd3lB2RV38 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rd3lB2RV38 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rd3lB2RV38 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rd3lB2RV38 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rd3lB2RV38 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rd3lB2RV38 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rd3lB2RV38 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rd3lB2RV38 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rd3lB2RV38 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rd3lB2RV38 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rd3lB2RV38 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rd3lB2RV38 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rd3lB2RV38 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rd3lB2RV38 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rd3lB2RV38 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rd3lB2RV38 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rd3lB2RV38 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rd3lB2RV38 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rd3lB2RV38 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Rd3lB2RV38 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rd3lB2RV38 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rd3lB2RV38 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rd3lB2RV38 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rd3lB2RV38 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rd3lB2RV38 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rd3lB2RV38 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rd3lB2RV38 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rd3lB2RV38 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rd3lB2RV38 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rd3lB2RV38 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rd3lB2RV38 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rd3lB2RV38 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rd3lB2RV38 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rd3lB2RV38 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rd3lB2RV38 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rd3lB2RV38 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rd3lB2RV38 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rd3lB2RV38 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rd3lB2RV38 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rd3lB2RV38 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rd3lB2RV38 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rd3lB2RV38 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rd3lB2RV38 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rd3lB2RV38 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rd3lB2RV38 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rd3lB2RV38 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rd3lB2RV38 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rd3lB2RV38 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.5 ms