Protein–RNA interactions for Protein: B2RU80

Ptprb, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,998 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprbB2RU80 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PtprbB2RU80 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PtprbB2RU80 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
PtprbB2RU80 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
PtprbB2RU80 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PtprbB2RU80 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PtprbB2RU80 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PtprbB2RU80 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PtprbB2RU80 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
PtprbB2RU80 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PtprbB2RU80 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
PtprbB2RU80 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PtprbB2RU80 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PtprbB2RU80 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
PtprbB2RU80 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PtprbB2RU80 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PtprbB2RU80 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PtprbB2RU80 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
PtprbB2RU80 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
PtprbB2RU80 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
PtprbB2RU80 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PtprbB2RU80 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PtprbB2RU80 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PtprbB2RU80 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PtprbB2RU80 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PtprbB2RU80 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
PtprbB2RU80 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
PtprbB2RU80 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
PtprbB2RU80 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
PtprbB2RU80 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
PtprbB2RU80 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PtprbB2RU80 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PtprbB2RU80 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PtprbB2RU80 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
PtprbB2RU80 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PtprbB2RU80 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PtprbB2RU80 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
PtprbB2RU80 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PtprbB2RU80 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PtprbB2RU80 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
PtprbB2RU80 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
PtprbB2RU80 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PtprbB2RU80 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PtprbB2RU80 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PtprbB2RU80 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PtprbB2RU80 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
PtprbB2RU80 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
PtprbB2RU80 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PtprbB2RU80 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PtprbB2RU80 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PtprbB2RU80 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
PtprbB2RU80 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
PtprbB2RU80 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
PtprbB2RU80 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PtprbB2RU80 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
PtprbB2RU80 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PtprbB2RU80 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PtprbB2RU80 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PtprbB2RU80 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
PtprbB2RU80 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
PtprbB2RU80 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PtprbB2RU80 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PtprbB2RU80 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PtprbB2RU80 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PtprbB2RU80 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PtprbB2RU80 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PtprbB2RU80 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
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PtprbB2RU80 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PtprbB2RU80 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PtprbB2RU80 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
PtprbB2RU80 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PtprbB2RU80 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PtprbB2RU80 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
PtprbB2RU80 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PtprbB2RU80 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PtprbB2RU80 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
PtprbB2RU80 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PtprbB2RU80 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
PtprbB2RU80 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PtprbB2RU80 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
PtprbB2RU80 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
PtprbB2RU80 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PtprbB2RU80 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PtprbB2RU80 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PtprbB2RU80 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PtprbB2RU80 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PtprbB2RU80 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PtprbB2RU80 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
PtprbB2RU80 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PtprbB2RU80 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PtprbB2RU80 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PtprbB2RU80 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PtprbB2RU80 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PtprbB2RU80 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PtprbB2RU80 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PtprbB2RU80 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PtprbB2RU80 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PtprbB2RU80 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PtprbB2RU80 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
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