Protein–RNA interactions for Protein: B2RRE7

Otud4, OTU domain-containing protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otud4B2RRE7 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Otud4B2RRE7 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Otud4B2RRE7 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Otud4B2RRE7 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Otud4B2RRE7 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Otud4B2RRE7 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Otud4B2RRE7 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Otud4B2RRE7 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Otud4B2RRE7 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Otud4B2RRE7 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Otud4B2RRE7 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Otud4B2RRE7 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Otud4B2RRE7 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Otud4B2RRE7 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Otud4B2RRE7 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Otud4B2RRE7 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Otud4B2RRE7 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Otud4B2RRE7 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Otud4B2RRE7 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Otud4B2RRE7 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Otud4B2RRE7 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Otud4B2RRE7 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Otud4B2RRE7 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Otud4B2RRE7 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Otud4B2RRE7 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Otud4B2RRE7 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Otud4B2RRE7 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Otud4B2RRE7 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Otud4B2RRE7 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Otud4B2RRE7 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Otud4B2RRE7 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Otud4B2RRE7 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Otud4B2RRE7 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Otud4B2RRE7 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Otud4B2RRE7 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Otud4B2RRE7 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Otud4B2RRE7 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Otud4B2RRE7 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Otud4B2RRE7 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Otud4B2RRE7 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Otud4B2RRE7 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Otud4B2RRE7 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Otud4B2RRE7 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Otud4B2RRE7 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Otud4B2RRE7 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Otud4B2RRE7 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Otud4B2RRE7 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Otud4B2RRE7 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Otud4B2RRE7 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Otud4B2RRE7 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Otud4B2RRE7 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Otud4B2RRE7 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Otud4B2RRE7 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Otud4B2RRE7 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Otud4B2RRE7 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Otud4B2RRE7 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Otud4B2RRE7 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Otud4B2RRE7 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Otud4B2RRE7 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Otud4B2RRE7 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Otud4B2RRE7 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Otud4B2RRE7 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Otud4B2RRE7 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Otud4B2RRE7 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Otud4B2RRE7 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Otud4B2RRE7 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Otud4B2RRE7 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Otud4B2RRE7 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Otud4B2RRE7 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Otud4B2RRE7 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Otud4B2RRE7 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Otud4B2RRE7 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Otud4B2RRE7 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Otud4B2RRE7 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Otud4B2RRE7 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Otud4B2RRE7 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Otud4B2RRE7 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Otud4B2RRE7 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Otud4B2RRE7 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Otud4B2RRE7 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Otud4B2RRE7 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Otud4B2RRE7 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Otud4B2RRE7 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Otud4B2RRE7 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Otud4B2RRE7 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Otud4B2RRE7 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Otud4B2RRE7 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Otud4B2RRE7 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Otud4B2RRE7 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Otud4B2RRE7 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Otud4B2RRE7 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Otud4B2RRE7 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Otud4B2RRE7 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Otud4B2RRE7 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Otud4B2RRE7 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Otud4B2RRE7 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Otud4B2RRE7 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Otud4B2RRE7 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Otud4B2RRE7 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Otud4B2RRE7 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms