Protein–RNA interactions for Protein: B2RRE4

Znf518b, Zinc finger protein 518B, mousemouse

Predictions only

Length 1,077 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf518bB2RRE4 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Znf518bB2RRE4 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Znf518bB2RRE4 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Znf518bB2RRE4 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Znf518bB2RRE4 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Znf518bB2RRE4 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Znf518bB2RRE4 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Znf518bB2RRE4 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Znf518bB2RRE4 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Znf518bB2RRE4 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Znf518bB2RRE4 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Znf518bB2RRE4 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Znf518bB2RRE4 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Znf518bB2RRE4 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Znf518bB2RRE4 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Znf518bB2RRE4 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Znf518bB2RRE4 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Znf518bB2RRE4 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Znf518bB2RRE4 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Znf518bB2RRE4 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Znf518bB2RRE4 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Znf518bB2RRE4 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Znf518bB2RRE4 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Znf518bB2RRE4 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Znf518bB2RRE4 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Znf518bB2RRE4 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Znf518bB2RRE4 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Znf518bB2RRE4 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Znf518bB2RRE4 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Znf518bB2RRE4 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Znf518bB2RRE4 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Znf518bB2RRE4 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Znf518bB2RRE4 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Znf518bB2RRE4 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Znf518bB2RRE4 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Znf518bB2RRE4 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Znf518bB2RRE4 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Znf518bB2RRE4 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Znf518bB2RRE4 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Znf518bB2RRE4 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Znf518bB2RRE4 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Znf518bB2RRE4 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Znf518bB2RRE4 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Znf518bB2RRE4 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Znf518bB2RRE4 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Znf518bB2RRE4 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Znf518bB2RRE4 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Znf518bB2RRE4 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Znf518bB2RRE4 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Znf518bB2RRE4 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Znf518bB2RRE4 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Znf518bB2RRE4 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Znf518bB2RRE4 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Znf518bB2RRE4 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Znf518bB2RRE4 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Znf518bB2RRE4 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Znf518bB2RRE4 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Znf518bB2RRE4 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Znf518bB2RRE4 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Znf518bB2RRE4 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Znf518bB2RRE4 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Znf518bB2RRE4 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Znf518bB2RRE4 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Znf518bB2RRE4 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Znf518bB2RRE4 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Znf518bB2RRE4 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Znf518bB2RRE4 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Znf518bB2RRE4 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Znf518bB2RRE4 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Znf518bB2RRE4 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Znf518bB2RRE4 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Znf518bB2RRE4 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Znf518bB2RRE4 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Znf518bB2RRE4 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Znf518bB2RRE4 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Znf518bB2RRE4 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Znf518bB2RRE4 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Znf518bB2RRE4 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Znf518bB2RRE4 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Znf518bB2RRE4 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Znf518bB2RRE4 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Znf518bB2RRE4 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Znf518bB2RRE4 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Znf518bB2RRE4 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Znf518bB2RRE4 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Znf518bB2RRE4 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Znf518bB2RRE4 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Znf518bB2RRE4 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Znf518bB2RRE4 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Znf518bB2RRE4 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Znf518bB2RRE4 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Znf518bB2RRE4 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Znf518bB2RRE4 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Znf518bB2RRE4 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Znf518bB2RRE4 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Znf518bB2RRE4 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Znf518bB2RRE4 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Znf518bB2RRE4 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Znf518bB2RRE4 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Znf518bB2RRE4 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms