Protein–RNA interactions for Protein: B2KF05

Brpf3, Bromodomain and PHD finger-containing, 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brpf3B2KF05 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Brpf3B2KF05 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Brpf3B2KF05 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Brpf3B2KF05 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Brpf3B2KF05 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Brpf3B2KF05 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Brpf3B2KF05 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Brpf3B2KF05 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Brpf3B2KF05 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Brpf3B2KF05 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Brpf3B2KF05 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Brpf3B2KF05 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Brpf3B2KF05 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Brpf3B2KF05 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Brpf3B2KF05 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Brpf3B2KF05 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Brpf3B2KF05 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Brpf3B2KF05 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Brpf3B2KF05 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Brpf3B2KF05 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Brpf3B2KF05 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Brpf3B2KF05 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Brpf3B2KF05 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Brpf3B2KF05 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Brpf3B2KF05 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Brpf3B2KF05 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Brpf3B2KF05 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Brpf3B2KF05 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Brpf3B2KF05 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Brpf3B2KF05 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Brpf3B2KF05 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Brpf3B2KF05 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Brpf3B2KF05 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Brpf3B2KF05 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Brpf3B2KF05 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Brpf3B2KF05 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Brpf3B2KF05 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Brpf3B2KF05 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Brpf3B2KF05 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Brpf3B2KF05 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Brpf3B2KF05 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Brpf3B2KF05 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Brpf3B2KF05 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Brpf3B2KF05 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Brpf3B2KF05 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Brpf3B2KF05 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Brpf3B2KF05 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Brpf3B2KF05 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Brpf3B2KF05 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Brpf3B2KF05 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Brpf3B2KF05 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Brpf3B2KF05 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Brpf3B2KF05 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Brpf3B2KF05 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Brpf3B2KF05 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Brpf3B2KF05 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Brpf3B2KF05 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Brpf3B2KF05 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Brpf3B2KF05 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Brpf3B2KF05 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Brpf3B2KF05 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Brpf3B2KF05 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Brpf3B2KF05 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Brpf3B2KF05 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Brpf3B2KF05 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Brpf3B2KF05 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Brpf3B2KF05 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Brpf3B2KF05 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Brpf3B2KF05 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Brpf3B2KF05 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Brpf3B2KF05 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Brpf3B2KF05 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Brpf3B2KF05 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Brpf3B2KF05 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Brpf3B2KF05 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Brpf3B2KF05 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Brpf3B2KF05 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Brpf3B2KF05 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Brpf3B2KF05 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Brpf3B2KF05 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Brpf3B2KF05 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Brpf3B2KF05 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Brpf3B2KF05 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Brpf3B2KF05 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Brpf3B2KF05 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Brpf3B2KF05 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Brpf3B2KF05 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Brpf3B2KF05 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Brpf3B2KF05 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Brpf3B2KF05 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Brpf3B2KF05 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Brpf3B2KF05 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Brpf3B2KF05 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Brpf3B2KF05 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Brpf3B2KF05 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Brpf3B2KF05 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Brpf3B2KF05 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Brpf3B2KF05 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Brpf3B2KF05 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Brpf3B2KF05 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms