Protein–RNA interactions for Protein: B1B0R1

Gm2012, Predicted gene 2012, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2012B1B0R1 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm2012B1B0R1 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm2012B1B0R1 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm2012B1B0R1 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm2012B1B0R1 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm2012B1B0R1 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm2012B1B0R1 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm2012B1B0R1 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm2012B1B0R1 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm2012B1B0R1 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm2012B1B0R1 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm2012B1B0R1 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm2012B1B0R1 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm2012B1B0R1 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm2012B1B0R1 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm2012B1B0R1 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm2012B1B0R1 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm2012B1B0R1 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm2012B1B0R1 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm2012B1B0R1 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm2012B1B0R1 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm2012B1B0R1 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm2012B1B0R1 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm2012B1B0R1 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm2012B1B0R1 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm2012B1B0R1 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm2012B1B0R1 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm2012B1B0R1 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm2012B1B0R1 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm2012B1B0R1 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm2012B1B0R1 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm2012B1B0R1 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm2012B1B0R1 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm2012B1B0R1 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm2012B1B0R1 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm2012B1B0R1 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm2012B1B0R1 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm2012B1B0R1 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm2012B1B0R1 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm2012B1B0R1 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm2012B1B0R1 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm2012B1B0R1 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm2012B1B0R1 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm2012B1B0R1 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm2012B1B0R1 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm2012B1B0R1 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm2012B1B0R1 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm2012B1B0R1 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm2012B1B0R1 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm2012B1B0R1 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm2012B1B0R1 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm2012B1B0R1 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm2012B1B0R1 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm2012B1B0R1 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm2012B1B0R1 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm2012B1B0R1 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm2012B1B0R1 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm2012B1B0R1 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm2012B1B0R1 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm2012B1B0R1 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm2012B1B0R1 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm2012B1B0R1 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm2012B1B0R1 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm2012B1B0R1 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm2012B1B0R1 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm2012B1B0R1 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm2012B1B0R1 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm2012B1B0R1 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm2012B1B0R1 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm2012B1B0R1 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm2012B1B0R1 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm2012B1B0R1 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm2012B1B0R1 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm2012B1B0R1 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm2012B1B0R1 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm2012B1B0R1 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm2012B1B0R1 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm2012B1B0R1 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm2012B1B0R1 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm2012B1B0R1 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm2012B1B0R1 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm2012B1B0R1 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm2012B1B0R1 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm2012B1B0R1 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm2012B1B0R1 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm2012B1B0R1 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm2012B1B0R1 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm2012B1B0R1 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm2012B1B0R1 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm2012B1B0R1 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm2012B1B0R1 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm2012B1B0R1 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm2012B1B0R1 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm2012B1B0R1 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm2012B1B0R1 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm2012B1B0R1 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm2012B1B0R1 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm2012B1B0R1 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm2012B1B0R1 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm2012B1B0R1 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.7 ms