Protein–RNA interactions for Protein: B1ASB6

Spocd1, SPOC domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 936 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spocd1B1ASB6 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Spocd1B1ASB6 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Spocd1B1ASB6 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Spocd1B1ASB6 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Spocd1B1ASB6 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Spocd1B1ASB6 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Spocd1B1ASB6 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Spocd1B1ASB6 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Spocd1B1ASB6 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Spocd1B1ASB6 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Spocd1B1ASB6 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Spocd1B1ASB6 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Spocd1B1ASB6 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Spocd1B1ASB6 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Spocd1B1ASB6 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Spocd1B1ASB6 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Spocd1B1ASB6 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Spocd1B1ASB6 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Spocd1B1ASB6 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Spocd1B1ASB6 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Spocd1B1ASB6 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Spocd1B1ASB6 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Spocd1B1ASB6 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Spocd1B1ASB6 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Spocd1B1ASB6 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Spocd1B1ASB6 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Spocd1B1ASB6 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Spocd1B1ASB6 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Spocd1B1ASB6 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Spocd1B1ASB6 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Spocd1B1ASB6 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Spocd1B1ASB6 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Spocd1B1ASB6 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Spocd1B1ASB6 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Spocd1B1ASB6 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Spocd1B1ASB6 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Spocd1B1ASB6 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Spocd1B1ASB6 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Spocd1B1ASB6 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Spocd1B1ASB6 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Spocd1B1ASB6 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Spocd1B1ASB6 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Spocd1B1ASB6 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Spocd1B1ASB6 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Spocd1B1ASB6 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Spocd1B1ASB6 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Spocd1B1ASB6 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Spocd1B1ASB6 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Spocd1B1ASB6 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Spocd1B1ASB6 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Spocd1B1ASB6 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Spocd1B1ASB6 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Spocd1B1ASB6 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Spocd1B1ASB6 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Spocd1B1ASB6 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Spocd1B1ASB6 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Spocd1B1ASB6 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Spocd1B1ASB6 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Spocd1B1ASB6 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Spocd1B1ASB6 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Spocd1B1ASB6 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Spocd1B1ASB6 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Spocd1B1ASB6 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Spocd1B1ASB6 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Spocd1B1ASB6 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Spocd1B1ASB6 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Spocd1B1ASB6 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Spocd1B1ASB6 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Spocd1B1ASB6 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Spocd1B1ASB6 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Spocd1B1ASB6 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Spocd1B1ASB6 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Spocd1B1ASB6 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Spocd1B1ASB6 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Spocd1B1ASB6 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Spocd1B1ASB6 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Spocd1B1ASB6 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Spocd1B1ASB6 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Spocd1B1ASB6 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Spocd1B1ASB6 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Spocd1B1ASB6 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Spocd1B1ASB6 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Spocd1B1ASB6 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Spocd1B1ASB6 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Spocd1B1ASB6 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Spocd1B1ASB6 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Spocd1B1ASB6 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Spocd1B1ASB6 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Spocd1B1ASB6 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Spocd1B1ASB6 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Spocd1B1ASB6 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Spocd1B1ASB6 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Spocd1B1ASB6 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Spocd1B1ASB6 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Spocd1B1ASB6 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Spocd1B1ASB6 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Spocd1B1ASB6 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Spocd1B1ASB6 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Spocd1B1ASB6 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Spocd1B1ASB6 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms