Protein–RNA interactions for Protein: A7XV07

Skint8, Selection and upkeep of intraepithelial T-cells protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skint8A7XV07 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Skint8A7XV07 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Skint8A7XV07 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Skint8A7XV07 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Skint8A7XV07 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Skint8A7XV07 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Skint8A7XV07 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Skint8A7XV07 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Skint8A7XV07 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Skint8A7XV07 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Skint8A7XV07 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Skint8A7XV07 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Skint8A7XV07 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Skint8A7XV07 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Skint8A7XV07 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Skint8A7XV07 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Skint8A7XV07 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Skint8A7XV07 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Skint8A7XV07 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Skint8A7XV07 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Skint8A7XV07 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Skint8A7XV07 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Skint8A7XV07 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Skint8A7XV07 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Skint8A7XV07 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Skint8A7XV07 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Skint8A7XV07 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Skint8A7XV07 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Skint8A7XV07 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Skint8A7XV07 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Skint8A7XV07 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Skint8A7XV07 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Skint8A7XV07 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Skint8A7XV07 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Skint8A7XV07 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Skint8A7XV07 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Skint8A7XV07 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Skint8A7XV07 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Skint8A7XV07 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Skint8A7XV07 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Skint8A7XV07 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Skint8A7XV07 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Skint8A7XV07 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Skint8A7XV07 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Skint8A7XV07 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Skint8A7XV07 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Skint8A7XV07 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Skint8A7XV07 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Skint8A7XV07 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Skint8A7XV07 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Skint8A7XV07 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Skint8A7XV07 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Skint8A7XV07 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Skint8A7XV07 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Skint8A7XV07 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Skint8A7XV07 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Skint8A7XV07 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Skint8A7XV07 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Skint8A7XV07 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Skint8A7XV07 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Skint8A7XV07 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Skint8A7XV07 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Skint8A7XV07 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Skint8A7XV07 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Skint8A7XV07 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Skint8A7XV07 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Skint8A7XV07 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Skint8A7XV07 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Skint8A7XV07 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Skint8A7XV07 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Skint8A7XV07 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Skint8A7XV07 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Skint8A7XV07 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Skint8A7XV07 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Skint8A7XV07 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Skint8A7XV07 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Skint8A7XV07 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Skint8A7XV07 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Skint8A7XV07 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Skint8A7XV07 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Skint8A7XV07 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Skint8A7XV07 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Skint8A7XV07 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Skint8A7XV07 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Skint8A7XV07 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Skint8A7XV07 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Skint8A7XV07 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Skint8A7XV07 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Skint8A7XV07 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Skint8A7XV07 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Skint8A7XV07 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Skint8A7XV07 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Skint8A7XV07 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Skint8A7XV07 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Skint8A7XV07 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Skint8A7XV07 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Skint8A7XV07 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Skint8A7XV07 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Skint8A7XV07 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Skint8A7XV07 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms