Protein–RNA interactions for Protein: A7VMS2

Gm11127, MHC classIb T15, mousemouse

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Length 374 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm11127A7VMS2 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm11127A7VMS2 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm11127A7VMS2 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm11127A7VMS2 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm11127A7VMS2 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm11127A7VMS2 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm11127A7VMS2 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm11127A7VMS2 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm11127A7VMS2 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm11127A7VMS2 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm11127A7VMS2 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm11127A7VMS2 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm11127A7VMS2 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Gm11127A7VMS2 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Gm11127A7VMS2 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm11127A7VMS2 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm11127A7VMS2 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm11127A7VMS2 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm11127A7VMS2 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm11127A7VMS2 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm11127A7VMS2 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm11127A7VMS2 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm11127A7VMS2 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm11127A7VMS2 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm11127A7VMS2 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm11127A7VMS2 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm11127A7VMS2 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm11127A7VMS2 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm11127A7VMS2 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
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Gm11127A7VMS2 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm11127A7VMS2 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm11127A7VMS2 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm11127A7VMS2 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm11127A7VMS2 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm11127A7VMS2 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm11127A7VMS2 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm11127A7VMS2 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm11127A7VMS2 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm11127A7VMS2 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm11127A7VMS2 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm11127A7VMS2 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm11127A7VMS2 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm11127A7VMS2 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm11127A7VMS2 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm11127A7VMS2 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm11127A7VMS2 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm11127A7VMS2 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm11127A7VMS2 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm11127A7VMS2 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm11127A7VMS2 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm11127A7VMS2 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm11127A7VMS2 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm11127A7VMS2 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm11127A7VMS2 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm11127A7VMS2 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm11127A7VMS2 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm11127A7VMS2 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm11127A7VMS2 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm11127A7VMS2 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm11127A7VMS2 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm11127A7VMS2 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm11127A7VMS2 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm11127A7VMS2 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm11127A7VMS2 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
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Gm11127A7VMS2 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
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Gm11127A7VMS2 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm11127A7VMS2 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm11127A7VMS2 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm11127A7VMS2 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm11127A7VMS2 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm11127A7VMS2 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm11127A7VMS2 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm11127A7VMS2 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm11127A7VMS2 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm11127A7VMS2 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm11127A7VMS2 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm11127A7VMS2 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm11127A7VMS2 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm11127A7VMS2 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm11127A7VMS2 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm11127A7VMS2 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm11127A7VMS2 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm11127A7VMS2 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm11127A7VMS2 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm11127A7VMS2 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm11127A7VMS2 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm11127A7VMS2 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm11127A7VMS2 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm11127A7VMS2 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm11127A7VMS2 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm11127A7VMS2 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm11127A7VMS2 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm11127A7VMS2 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm11127A7VMS2 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm11127A7VMS2 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm11127A7VMS2 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm11127A7VMS2 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
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