Protein–RNA interactions for Protein: A3KGV1

Odf2, Outer dense fiber protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 830 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odf2A3KGV1 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Odf2A3KGV1 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Odf2A3KGV1 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Odf2A3KGV1 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Odf2A3KGV1 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Odf2A3KGV1 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Odf2A3KGV1 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Odf2A3KGV1 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Odf2A3KGV1 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Odf2A3KGV1 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Odf2A3KGV1 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Odf2A3KGV1 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Odf2A3KGV1 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Odf2A3KGV1 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Odf2A3KGV1 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Odf2A3KGV1 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Odf2A3KGV1 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Odf2A3KGV1 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Odf2A3KGV1 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Odf2A3KGV1 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Odf2A3KGV1 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Odf2A3KGV1 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Odf2A3KGV1 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Odf2A3KGV1 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Odf2A3KGV1 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Odf2A3KGV1 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Odf2A3KGV1 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Odf2A3KGV1 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Odf2A3KGV1 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Odf2A3KGV1 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Odf2A3KGV1 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Odf2A3KGV1 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Odf2A3KGV1 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Odf2A3KGV1 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Odf2A3KGV1 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Odf2A3KGV1 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Odf2A3KGV1 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Odf2A3KGV1 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Odf2A3KGV1 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Odf2A3KGV1 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Odf2A3KGV1 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Odf2A3KGV1 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Odf2A3KGV1 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Odf2A3KGV1 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Odf2A3KGV1 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Odf2A3KGV1 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Odf2A3KGV1 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Odf2A3KGV1 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Odf2A3KGV1 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Odf2A3KGV1 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Odf2A3KGV1 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Odf2A3KGV1 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Odf2A3KGV1 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Odf2A3KGV1 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Odf2A3KGV1 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Odf2A3KGV1 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Odf2A3KGV1 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Odf2A3KGV1 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Odf2A3KGV1 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Odf2A3KGV1 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Odf2A3KGV1 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Odf2A3KGV1 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Odf2A3KGV1 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Odf2A3KGV1 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Odf2A3KGV1 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Odf2A3KGV1 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Odf2A3KGV1 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Odf2A3KGV1 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Odf2A3KGV1 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Odf2A3KGV1 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Odf2A3KGV1 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Odf2A3KGV1 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Odf2A3KGV1 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Odf2A3KGV1 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Odf2A3KGV1 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Odf2A3KGV1 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Odf2A3KGV1 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Odf2A3KGV1 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Odf2A3KGV1 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Odf2A3KGV1 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Odf2A3KGV1 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Odf2A3KGV1 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Odf2A3KGV1 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Odf2A3KGV1 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Odf2A3KGV1 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Odf2A3KGV1 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Odf2A3KGV1 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Odf2A3KGV1 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Odf2A3KGV1 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Odf2A3KGV1 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Odf2A3KGV1 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Odf2A3KGV1 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Odf2A3KGV1 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Odf2A3KGV1 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Odf2A3KGV1 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Odf2A3KGV1 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Odf2A3KGV1 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Odf2A3KGV1 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Odf2A3KGV1 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Odf2A3KGV1 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.8 ms