Protein–RNA interactions for Protein: A3KG49

Gm5640, Predicted gene 5640, mousemouse

Predictions only

Length 728 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5640A3KG49 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm5640A3KG49 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm5640A3KG49 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm5640A3KG49 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm5640A3KG49 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm5640A3KG49 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm5640A3KG49 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm5640A3KG49 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm5640A3KG49 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm5640A3KG49 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm5640A3KG49 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm5640A3KG49 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm5640A3KG49 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm5640A3KG49 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm5640A3KG49 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm5640A3KG49 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm5640A3KG49 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm5640A3KG49 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm5640A3KG49 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm5640A3KG49 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm5640A3KG49 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm5640A3KG49 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm5640A3KG49 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm5640A3KG49 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm5640A3KG49 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm5640A3KG49 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm5640A3KG49 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm5640A3KG49 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm5640A3KG49 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm5640A3KG49 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gm5640A3KG49 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gm5640A3KG49 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gm5640A3KG49 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gm5640A3KG49 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gm5640A3KG49 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm5640A3KG49 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm5640A3KG49 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm5640A3KG49 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm5640A3KG49 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm5640A3KG49 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm5640A3KG49 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm5640A3KG49 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm5640A3KG49 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm5640A3KG49 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm5640A3KG49 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm5640A3KG49 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm5640A3KG49 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm5640A3KG49 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm5640A3KG49 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm5640A3KG49 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm5640A3KG49 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm5640A3KG49 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm5640A3KG49 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm5640A3KG49 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm5640A3KG49 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm5640A3KG49 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm5640A3KG49 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm5640A3KG49 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm5640A3KG49 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm5640A3KG49 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm5640A3KG49 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm5640A3KG49 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm5640A3KG49 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm5640A3KG49 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm5640A3KG49 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm5640A3KG49 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm5640A3KG49 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm5640A3KG49 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm5640A3KG49 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm5640A3KG49 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm5640A3KG49 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm5640A3KG49 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm5640A3KG49 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm5640A3KG49 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm5640A3KG49 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm5640A3KG49 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm5640A3KG49 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm5640A3KG49 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm5640A3KG49 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm5640A3KG49 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm5640A3KG49 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm5640A3KG49 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm5640A3KG49 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm5640A3KG49 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm5640A3KG49 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm5640A3KG49 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm5640A3KG49 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm5640A3KG49 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm5640A3KG49 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm5640A3KG49 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm5640A3KG49 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm5640A3KG49 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm5640A3KG49 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm5640A3KG49 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm5640A3KG49 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm5640A3KG49 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm5640A3KG49 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm5640A3KG49 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm5640A3KG49 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm5640A3KG49 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms