Protein–RNA interactions for Protein: A2TJV2

Palm3, Paralemmin-3, mousemouse

Predictions only

Length 734 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Palm3A2TJV2 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Palm3A2TJV2 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Palm3A2TJV2 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Palm3A2TJV2 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Palm3A2TJV2 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Palm3A2TJV2 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Palm3A2TJV2 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Palm3A2TJV2 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Palm3A2TJV2 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Palm3A2TJV2 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Palm3A2TJV2 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Palm3A2TJV2 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Palm3A2TJV2 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Palm3A2TJV2 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Palm3A2TJV2 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Palm3A2TJV2 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Palm3A2TJV2 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Palm3A2TJV2 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Palm3A2TJV2 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Palm3A2TJV2 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Palm3A2TJV2 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Palm3A2TJV2 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Palm3A2TJV2 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Palm3A2TJV2 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Palm3A2TJV2 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Palm3A2TJV2 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Palm3A2TJV2 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Palm3A2TJV2 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Palm3A2TJV2 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Palm3A2TJV2 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Palm3A2TJV2 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Palm3A2TJV2 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Palm3A2TJV2 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Palm3A2TJV2 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Palm3A2TJV2 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Palm3A2TJV2 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Palm3A2TJV2 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Palm3A2TJV2 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Palm3A2TJV2 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Palm3A2TJV2 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Palm3A2TJV2 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Palm3A2TJV2 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Palm3A2TJV2 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Palm3A2TJV2 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Palm3A2TJV2 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Palm3A2TJV2 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Palm3A2TJV2 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Palm3A2TJV2 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Palm3A2TJV2 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Palm3A2TJV2 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Palm3A2TJV2 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Palm3A2TJV2 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Palm3A2TJV2 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Palm3A2TJV2 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Palm3A2TJV2 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Palm3A2TJV2 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Palm3A2TJV2 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Palm3A2TJV2 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Palm3A2TJV2 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Palm3A2TJV2 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Palm3A2TJV2 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Palm3A2TJV2 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Palm3A2TJV2 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Palm3A2TJV2 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Palm3A2TJV2 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Palm3A2TJV2 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Palm3A2TJV2 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Palm3A2TJV2 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Palm3A2TJV2 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Palm3A2TJV2 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Palm3A2TJV2 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Palm3A2TJV2 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Palm3A2TJV2 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Palm3A2TJV2 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Palm3A2TJV2 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Palm3A2TJV2 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Palm3A2TJV2 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Palm3A2TJV2 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Palm3A2TJV2 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Palm3A2TJV2 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Palm3A2TJV2 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Palm3A2TJV2 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Palm3A2TJV2 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Palm3A2TJV2 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Palm3A2TJV2 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Palm3A2TJV2 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Palm3A2TJV2 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Palm3A2TJV2 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Palm3A2TJV2 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Palm3A2TJV2 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Palm3A2TJV2 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Palm3A2TJV2 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Palm3A2TJV2 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Palm3A2TJV2 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Palm3A2TJV2 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Palm3A2TJV2 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Palm3A2TJV2 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Palm3A2TJV2 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Palm3A2TJV2 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Palm3A2TJV2 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms