Protein–RNA interactions for Protein: A2ARI4

Lgr4, Leucine-rich repeat-containing G-protein coupled receptor 4, mousemouse

Predictions only

Length 951 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lgr4A2ARI4 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lgr4A2ARI4 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Lgr4A2ARI4 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lgr4A2ARI4 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lgr4A2ARI4 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lgr4A2ARI4 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Lgr4A2ARI4 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lgr4A2ARI4 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lgr4A2ARI4 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Lgr4A2ARI4 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lgr4A2ARI4 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lgr4A2ARI4 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lgr4A2ARI4 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Lgr4A2ARI4 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Lgr4A2ARI4 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lgr4A2ARI4 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lgr4A2ARI4 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Lgr4A2ARI4 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lgr4A2ARI4 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lgr4A2ARI4 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lgr4A2ARI4 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lgr4A2ARI4 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Lgr4A2ARI4 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lgr4A2ARI4 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Lgr4A2ARI4 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Lgr4A2ARI4 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Lgr4A2ARI4 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Lgr4A2ARI4 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lgr4A2ARI4 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Lgr4A2ARI4 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Lgr4A2ARI4 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lgr4A2ARI4 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lgr4A2ARI4 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lgr4A2ARI4 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Lgr4A2ARI4 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lgr4A2ARI4 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lgr4A2ARI4 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lgr4A2ARI4 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lgr4A2ARI4 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Lgr4A2ARI4 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lgr4A2ARI4 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lgr4A2ARI4 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lgr4A2ARI4 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lgr4A2ARI4 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lgr4A2ARI4 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lgr4A2ARI4 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lgr4A2ARI4 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lgr4A2ARI4 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Lgr4A2ARI4 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lgr4A2ARI4 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lgr4A2ARI4 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lgr4A2ARI4 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lgr4A2ARI4 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lgr4A2ARI4 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lgr4A2ARI4 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Lgr4A2ARI4 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Lgr4A2ARI4 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Lgr4A2ARI4 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Lgr4A2ARI4 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Lgr4A2ARI4 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Lgr4A2ARI4 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lgr4A2ARI4 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lgr4A2ARI4 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lgr4A2ARI4 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lgr4A2ARI4 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lgr4A2ARI4 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lgr4A2ARI4 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lgr4A2ARI4 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Lgr4A2ARI4 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lgr4A2ARI4 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lgr4A2ARI4 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lgr4A2ARI4 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lgr4A2ARI4 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Lgr4A2ARI4 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Lgr4A2ARI4 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Lgr4A2ARI4 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Lgr4A2ARI4 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Lgr4A2ARI4 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lgr4A2ARI4 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Lgr4A2ARI4 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Lgr4A2ARI4 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Lgr4A2ARI4 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Lgr4A2ARI4 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lgr4A2ARI4 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Lgr4A2ARI4 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Lgr4A2ARI4 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lgr4A2ARI4 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lgr4A2ARI4 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lgr4A2ARI4 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Lgr4A2ARI4 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lgr4A2ARI4 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lgr4A2ARI4 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lgr4A2ARI4 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Lgr4A2ARI4 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lgr4A2ARI4 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lgr4A2ARI4 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lgr4A2ARI4 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lgr4A2ARI4 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lgr4A2ARI4 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Lgr4A2ARI4 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms