Protein–RNA interactions for Protein: A2AQ07

Tubb1, Tubulin beta-1 chain, mousemouse

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb1A2AQ07 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tubb1A2AQ07 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tubb1A2AQ07 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tubb1A2AQ07 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tubb1A2AQ07 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tubb1A2AQ07 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tubb1A2AQ07 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tubb1A2AQ07 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tubb1A2AQ07 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Tubb1A2AQ07 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tubb1A2AQ07 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tubb1A2AQ07 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tubb1A2AQ07 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tubb1A2AQ07 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tubb1A2AQ07 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tubb1A2AQ07 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tubb1A2AQ07 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tubb1A2AQ07 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tubb1A2AQ07 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tubb1A2AQ07 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tubb1A2AQ07 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tubb1A2AQ07 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tubb1A2AQ07 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tubb1A2AQ07 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tubb1A2AQ07 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tubb1A2AQ07 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tubb1A2AQ07 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tubb1A2AQ07 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tubb1A2AQ07 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tubb1A2AQ07 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tubb1A2AQ07 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tubb1A2AQ07 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tubb1A2AQ07 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tubb1A2AQ07 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Tubb1A2AQ07 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Tubb1A2AQ07 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tubb1A2AQ07 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tubb1A2AQ07 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tubb1A2AQ07 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tubb1A2AQ07 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tubb1A2AQ07 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tubb1A2AQ07 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tubb1A2AQ07 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tubb1A2AQ07 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tubb1A2AQ07 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tubb1A2AQ07 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tubb1A2AQ07 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tubb1A2AQ07 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tubb1A2AQ07 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tubb1A2AQ07 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tubb1A2AQ07 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tubb1A2AQ07 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tubb1A2AQ07 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Tubb1A2AQ07 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tubb1A2AQ07 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tubb1A2AQ07 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tubb1A2AQ07 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Tubb1A2AQ07 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Tubb1A2AQ07 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Tubb1A2AQ07 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Tubb1A2AQ07 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Tubb1A2AQ07 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Tubb1A2AQ07 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Tubb1A2AQ07 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Tubb1A2AQ07 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Tubb1A2AQ07 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Tubb1A2AQ07 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Tubb1A2AQ07 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Tubb1A2AQ07 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tubb1A2AQ07 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Tubb1A2AQ07 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Tubb1A2AQ07 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tubb1A2AQ07 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tubb1A2AQ07 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tubb1A2AQ07 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tubb1A2AQ07 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tubb1A2AQ07 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tubb1A2AQ07 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Tubb1A2AQ07 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Tubb1A2AQ07 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Tubb1A2AQ07 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tubb1A2AQ07 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tubb1A2AQ07 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tubb1A2AQ07 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tubb1A2AQ07 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tubb1A2AQ07 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tubb1A2AQ07 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tubb1A2AQ07 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tubb1A2AQ07 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tubb1A2AQ07 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tubb1A2AQ07 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tubb1A2AQ07 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tubb1A2AQ07 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tubb1A2AQ07 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tubb1A2AQ07 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tubb1A2AQ07 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tubb1A2AQ07 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tubb1A2AQ07 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tubb1A2AQ07 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tubb1A2AQ07 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms