Protein–RNA interactions for Protein: A2ALV5

AI481877, Expressed sequence AI481877, mousemouse

Predictions only

Length 1,481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AI481877A2ALV5 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
AI481877A2ALV5 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
AI481877A2ALV5 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
AI481877A2ALV5 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
AI481877A2ALV5 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
AI481877A2ALV5 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
AI481877A2ALV5 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
AI481877A2ALV5 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
AI481877A2ALV5 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
AI481877A2ALV5 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
AI481877A2ALV5 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
AI481877A2ALV5 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
AI481877A2ALV5 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
AI481877A2ALV5 Gm18827-201ENSMUST00000188341 790 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
AI481877A2ALV5 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
AI481877A2ALV5 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
AI481877A2ALV5 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
AI481877A2ALV5 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
AI481877A2ALV5 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
AI481877A2ALV5 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
AI481877A2ALV5 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
AI481877A2ALV5 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
AI481877A2ALV5 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
AI481877A2ALV5 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
AI481877A2ALV5 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
AI481877A2ALV5 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
AI481877A2ALV5 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
AI481877A2ALV5 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
AI481877A2ALV5 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
AI481877A2ALV5 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
AI481877A2ALV5 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
AI481877A2ALV5 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
AI481877A2ALV5 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
AI481877A2ALV5 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
AI481877A2ALV5 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
AI481877A2ALV5 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
AI481877A2ALV5 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
AI481877A2ALV5 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
AI481877A2ALV5 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
AI481877A2ALV5 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
AI481877A2ALV5 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
AI481877A2ALV5 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
AI481877A2ALV5 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
AI481877A2ALV5 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
AI481877A2ALV5 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
AI481877A2ALV5 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
AI481877A2ALV5 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
AI481877A2ALV5 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
AI481877A2ALV5 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
AI481877A2ALV5 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
AI481877A2ALV5 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
AI481877A2ALV5 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
AI481877A2ALV5 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
AI481877A2ALV5 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
AI481877A2ALV5 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
AI481877A2ALV5 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
AI481877A2ALV5 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
AI481877A2ALV5 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
AI481877A2ALV5 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
AI481877A2ALV5 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
AI481877A2ALV5 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
AI481877A2ALV5 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
AI481877A2ALV5 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
AI481877A2ALV5 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
AI481877A2ALV5 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
AI481877A2ALV5 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
AI481877A2ALV5 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
AI481877A2ALV5 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
AI481877A2ALV5 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
AI481877A2ALV5 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
AI481877A2ALV5 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
AI481877A2ALV5 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
AI481877A2ALV5 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
AI481877A2ALV5 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
AI481877A2ALV5 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
AI481877A2ALV5 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
AI481877A2ALV5 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
AI481877A2ALV5 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
AI481877A2ALV5 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
AI481877A2ALV5 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
AI481877A2ALV5 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
AI481877A2ALV5 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
AI481877A2ALV5 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
AI481877A2ALV5 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
AI481877A2ALV5 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
AI481877A2ALV5 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
AI481877A2ALV5 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
AI481877A2ALV5 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
AI481877A2ALV5 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
AI481877A2ALV5 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
AI481877A2ALV5 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
AI481877A2ALV5 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
AI481877A2ALV5 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
AI481877A2ALV5 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
AI481877A2ALV5 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
AI481877A2ALV5 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
AI481877A2ALV5 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
AI481877A2ALV5 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
AI481877A2ALV5 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
AI481877A2ALV5 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms