Protein–RNA interactions for Protein: A2AKB4

Frmpd1, FERM and PDZ domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frmpd1A2AKB4 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Frmpd1A2AKB4 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Frmpd1A2AKB4 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Frmpd1A2AKB4 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Frmpd1A2AKB4 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Frmpd1A2AKB4 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Frmpd1A2AKB4 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Frmpd1A2AKB4 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Frmpd1A2AKB4 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Frmpd1A2AKB4 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Frmpd1A2AKB4 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Frmpd1A2AKB4 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Frmpd1A2AKB4 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Frmpd1A2AKB4 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Frmpd1A2AKB4 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Frmpd1A2AKB4 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Frmpd1A2AKB4 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Frmpd1A2AKB4 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Frmpd1A2AKB4 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Frmpd1A2AKB4 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Frmpd1A2AKB4 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Frmpd1A2AKB4 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Frmpd1A2AKB4 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Frmpd1A2AKB4 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Frmpd1A2AKB4 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Frmpd1A2AKB4 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Frmpd1A2AKB4 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Frmpd1A2AKB4 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Frmpd1A2AKB4 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Frmpd1A2AKB4 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Frmpd1A2AKB4 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Frmpd1A2AKB4 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Frmpd1A2AKB4 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Frmpd1A2AKB4 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Frmpd1A2AKB4 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Frmpd1A2AKB4 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Frmpd1A2AKB4 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Frmpd1A2AKB4 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Frmpd1A2AKB4 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Frmpd1A2AKB4 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Frmpd1A2AKB4 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Frmpd1A2AKB4 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Frmpd1A2AKB4 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Frmpd1A2AKB4 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Frmpd1A2AKB4 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Frmpd1A2AKB4 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Frmpd1A2AKB4 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Frmpd1A2AKB4 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Frmpd1A2AKB4 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Frmpd1A2AKB4 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Frmpd1A2AKB4 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Frmpd1A2AKB4 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Frmpd1A2AKB4 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Frmpd1A2AKB4 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Frmpd1A2AKB4 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Frmpd1A2AKB4 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Frmpd1A2AKB4 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Frmpd1A2AKB4 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Frmpd1A2AKB4 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Frmpd1A2AKB4 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Frmpd1A2AKB4 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Frmpd1A2AKB4 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Frmpd1A2AKB4 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Frmpd1A2AKB4 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Frmpd1A2AKB4 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Frmpd1A2AKB4 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Frmpd1A2AKB4 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Frmpd1A2AKB4 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Frmpd1A2AKB4 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Frmpd1A2AKB4 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Frmpd1A2AKB4 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Frmpd1A2AKB4 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Frmpd1A2AKB4 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Frmpd1A2AKB4 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Frmpd1A2AKB4 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Frmpd1A2AKB4 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Frmpd1A2AKB4 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Frmpd1A2AKB4 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Frmpd1A2AKB4 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Frmpd1A2AKB4 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Frmpd1A2AKB4 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Frmpd1A2AKB4 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Frmpd1A2AKB4 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Frmpd1A2AKB4 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Frmpd1A2AKB4 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Frmpd1A2AKB4 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Frmpd1A2AKB4 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Frmpd1A2AKB4 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Frmpd1A2AKB4 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Frmpd1A2AKB4 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Frmpd1A2AKB4 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Frmpd1A2AKB4 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Frmpd1A2AKB4 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Frmpd1A2AKB4 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Frmpd1A2AKB4 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Frmpd1A2AKB4 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Frmpd1A2AKB4 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Frmpd1A2AKB4 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Frmpd1A2AKB4 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Frmpd1A2AKB4 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms