Protein–RNA interactions for Protein: A2AJ77

Prdm12, PR domain zinc finger protein 12, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm12A2AJ77 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Prdm12A2AJ77 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Prdm12A2AJ77 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Prdm12A2AJ77 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Prdm12A2AJ77 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Prdm12A2AJ77 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Prdm12A2AJ77 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Prdm12A2AJ77 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Prdm12A2AJ77 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Prdm12A2AJ77 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Prdm12A2AJ77 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Prdm12A2AJ77 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Prdm12A2AJ77 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Prdm12A2AJ77 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Prdm12A2AJ77 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Prdm12A2AJ77 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Prdm12A2AJ77 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Prdm12A2AJ77 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Prdm12A2AJ77 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Prdm12A2AJ77 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Prdm12A2AJ77 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Prdm12A2AJ77 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Prdm12A2AJ77 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Prdm12A2AJ77 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Prdm12A2AJ77 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Prdm12A2AJ77 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Prdm12A2AJ77 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Prdm12A2AJ77 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Prdm12A2AJ77 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Prdm12A2AJ77 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Prdm12A2AJ77 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Prdm12A2AJ77 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Prdm12A2AJ77 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Prdm12A2AJ77 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Prdm12A2AJ77 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Prdm12A2AJ77 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Prdm12A2AJ77 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Prdm12A2AJ77 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Prdm12A2AJ77 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Prdm12A2AJ77 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Prdm12A2AJ77 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Prdm12A2AJ77 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Prdm12A2AJ77 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Prdm12A2AJ77 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Prdm12A2AJ77 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Prdm12A2AJ77 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Prdm12A2AJ77 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Prdm12A2AJ77 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Prdm12A2AJ77 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Prdm12A2AJ77 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Prdm12A2AJ77 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Prdm12A2AJ77 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Prdm12A2AJ77 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Prdm12A2AJ77 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Prdm12A2AJ77 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Prdm12A2AJ77 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Prdm12A2AJ77 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Prdm12A2AJ77 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Prdm12A2AJ77 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Prdm12A2AJ77 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Prdm12A2AJ77 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Prdm12A2AJ77 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Prdm12A2AJ77 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Prdm12A2AJ77 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Prdm12A2AJ77 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Prdm12A2AJ77 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Prdm12A2AJ77 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Prdm12A2AJ77 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Prdm12A2AJ77 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Prdm12A2AJ77 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Prdm12A2AJ77 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Prdm12A2AJ77 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Prdm12A2AJ77 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Prdm12A2AJ77 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Prdm12A2AJ77 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Prdm12A2AJ77 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Prdm12A2AJ77 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Prdm12A2AJ77 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Prdm12A2AJ77 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Prdm12A2AJ77 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Prdm12A2AJ77 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Prdm12A2AJ77 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Prdm12A2AJ77 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Prdm12A2AJ77 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Prdm12A2AJ77 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Prdm12A2AJ77 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Prdm12A2AJ77 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Prdm12A2AJ77 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Prdm12A2AJ77 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Prdm12A2AJ77 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Prdm12A2AJ77 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Prdm12A2AJ77 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Prdm12A2AJ77 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Prdm12A2AJ77 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Prdm12A2AJ77 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Prdm12A2AJ77 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Prdm12A2AJ77 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Prdm12A2AJ77 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Prdm12A2AJ77 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Prdm12A2AJ77 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms