Protein–RNA interactions for Protein: A2AGD7

Ccdc163, Coiled-coil domain-containing 163, mousemouse

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc163A2AGD7 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc163A2AGD7 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc163A2AGD7 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc163A2AGD7 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc163A2AGD7 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc163A2AGD7 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc163A2AGD7 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc163A2AGD7 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc163A2AGD7 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc163A2AGD7 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc163A2AGD7 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc163A2AGD7 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc163A2AGD7 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc163A2AGD7 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc163A2AGD7 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc163A2AGD7 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc163A2AGD7 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc163A2AGD7 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc163A2AGD7 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc163A2AGD7 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc163A2AGD7 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc163A2AGD7 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc163A2AGD7 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc163A2AGD7 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc163A2AGD7 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc163A2AGD7 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc163A2AGD7 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc163A2AGD7 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc163A2AGD7 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc163A2AGD7 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc163A2AGD7 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc163A2AGD7 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc163A2AGD7 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc163A2AGD7 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc163A2AGD7 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc163A2AGD7 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc163A2AGD7 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc163A2AGD7 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc163A2AGD7 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc163A2AGD7 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc163A2AGD7 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc163A2AGD7 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc163A2AGD7 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc163A2AGD7 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc163A2AGD7 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc163A2AGD7 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc163A2AGD7 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc163A2AGD7 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc163A2AGD7 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc163A2AGD7 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc163A2AGD7 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc163A2AGD7 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc163A2AGD7 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc163A2AGD7 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc163A2AGD7 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc163A2AGD7 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc163A2AGD7 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc163A2AGD7 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc163A2AGD7 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc163A2AGD7 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc163A2AGD7 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc163A2AGD7 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc163A2AGD7 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc163A2AGD7 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc163A2AGD7 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc163A2AGD7 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc163A2AGD7 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc163A2AGD7 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc163A2AGD7 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc163A2AGD7 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc163A2AGD7 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc163A2AGD7 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc163A2AGD7 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc163A2AGD7 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc163A2AGD7 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc163A2AGD7 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc163A2AGD7 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc163A2AGD7 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc163A2AGD7 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc163A2AGD7 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc163A2AGD7 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc163A2AGD7 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc163A2AGD7 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc163A2AGD7 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc163A2AGD7 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc163A2AGD7 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc163A2AGD7 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc163A2AGD7 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc163A2AGD7 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc163A2AGD7 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc163A2AGD7 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc163A2AGD7 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc163A2AGD7 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc163A2AGD7 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc163A2AGD7 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc163A2AGD7 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc163A2AGD7 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc163A2AGD7 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc163A2AGD7 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc163A2AGD7 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms