Protein–RNA interactions for Protein: A0N8N6

Trav12-2, T cell receptor alpha variable 12-2 (Fragment), mousemouse

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Length 114 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trav12-2A0N8N6 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trav12-2A0N8N6 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trav12-2A0N8N6 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trav12-2A0N8N6 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trav12-2A0N8N6 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trav12-2A0N8N6 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trav12-2A0N8N6 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trav12-2A0N8N6 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trav12-2A0N8N6 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trav12-2A0N8N6 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trav12-2A0N8N6 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trav12-2A0N8N6 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trav12-2A0N8N6 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
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Trav12-2A0N8N6 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trav12-2A0N8N6 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trav12-2A0N8N6 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trav12-2A0N8N6 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trav12-2A0N8N6 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trav12-2A0N8N6 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trav12-2A0N8N6 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trav12-2A0N8N6 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trav12-2A0N8N6 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trav12-2A0N8N6 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trav12-2A0N8N6 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trav12-2A0N8N6 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trav12-2A0N8N6 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trav12-2A0N8N6 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trav12-2A0N8N6 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
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Trav12-2A0N8N6 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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Trav12-2A0N8N6 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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Trav12-2A0N8N6 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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Trav12-2A0N8N6 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trav12-2A0N8N6 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
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Trav12-2A0N8N6 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trav12-2A0N8N6 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trav12-2A0N8N6 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trav12-2A0N8N6 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trav12-2A0N8N6 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trav12-2A0N8N6 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trav12-2A0N8N6 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trav12-2A0N8N6 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trav12-2A0N8N6 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trav12-2A0N8N6 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trav12-2A0N8N6 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trav12-2A0N8N6 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trav12-2A0N8N6 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trav12-2A0N8N6 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trav12-2A0N8N6 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trav12-2A0N8N6 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trav12-2A0N8N6 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Trav12-2A0N8N6 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trav12-2A0N8N6 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trav12-2A0N8N6 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trav12-2A0N8N6 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trav12-2A0N8N6 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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