Protein–RNA interactions for Protein: A0A0N4SWI3

D6Ertd527e, DNA segment, Chr 6, ERATO Doi 527,-expressed, mousemouse

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Length 464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC8.97□□□□□ -0.97
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.97□□□□□ -0.97
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.97
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.97
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC8.95□□□□□ -0.98
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC8.95□□□□□ -0.98
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.95□□□□□ -0.98
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
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