Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2K1

Krt16, Keratin, type I cytoskeletal 16, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt16Q9Z2K1 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Krt16Q9Z2K1 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Krt16Q9Z2K1 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Krt16Q9Z2K1 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Krt16Q9Z2K1 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Krt16Q9Z2K1 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Krt16Q9Z2K1 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Krt16Q9Z2K1 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Krt16Q9Z2K1 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Krt16Q9Z2K1 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Krt16Q9Z2K1 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Krt16Q9Z2K1 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Krt16Q9Z2K1 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Krt16Q9Z2K1 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Krt16Q9Z2K1 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Krt16Q9Z2K1 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Krt16Q9Z2K1 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Krt16Q9Z2K1 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Krt16Q9Z2K1 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Krt16Q9Z2K1 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Krt16Q9Z2K1 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Krt16Q9Z2K1 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Krt16Q9Z2K1 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Krt16Q9Z2K1 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Krt16Q9Z2K1 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Krt16Q9Z2K1 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Krt16Q9Z2K1 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Krt16Q9Z2K1 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Krt16Q9Z2K1 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Krt16Q9Z2K1 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Krt16Q9Z2K1 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Krt16Q9Z2K1 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Krt16Q9Z2K1 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Krt16Q9Z2K1 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Krt16Q9Z2K1 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Krt16Q9Z2K1 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Krt16Q9Z2K1 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Krt16Q9Z2K1 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Krt16Q9Z2K1 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Krt16Q9Z2K1 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Krt16Q9Z2K1 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Krt16Q9Z2K1 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Krt16Q9Z2K1 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Krt16Q9Z2K1 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Krt16Q9Z2K1 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Krt16Q9Z2K1 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Krt16Q9Z2K1 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Krt16Q9Z2K1 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Krt16Q9Z2K1 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Krt16Q9Z2K1 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Krt16Q9Z2K1 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Krt16Q9Z2K1 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Krt16Q9Z2K1 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Krt16Q9Z2K1 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Krt16Q9Z2K1 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Krt16Q9Z2K1 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Krt16Q9Z2K1 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Krt16Q9Z2K1 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Krt16Q9Z2K1 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Krt16Q9Z2K1 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Krt16Q9Z2K1 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Krt16Q9Z2K1 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Krt16Q9Z2K1 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Krt16Q9Z2K1 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Krt16Q9Z2K1 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Krt16Q9Z2K1 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Krt16Q9Z2K1 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Krt16Q9Z2K1 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Krt16Q9Z2K1 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Krt16Q9Z2K1 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Krt16Q9Z2K1 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Krt16Q9Z2K1 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Krt16Q9Z2K1 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Krt16Q9Z2K1 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Krt16Q9Z2K1 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Krt16Q9Z2K1 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Krt16Q9Z2K1 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Krt16Q9Z2K1 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Krt16Q9Z2K1 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Krt16Q9Z2K1 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Krt16Q9Z2K1 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Krt16Q9Z2K1 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Krt16Q9Z2K1 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Krt16Q9Z2K1 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Krt16Q9Z2K1 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Krt16Q9Z2K1 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Krt16Q9Z2K1 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Krt16Q9Z2K1 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Krt16Q9Z2K1 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Krt16Q9Z2K1 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Krt16Q9Z2K1 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Krt16Q9Z2K1 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Krt16Q9Z2K1 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Krt16Q9Z2K1 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Krt16Q9Z2K1 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Krt16Q9Z2K1 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Krt16Q9Z2K1 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Krt16Q9Z2K1 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Krt16Q9Z2K1 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Krt16Q9Z2K1 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms