Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z238

Ccne2, G1/S-specific cyclin-E2, mousemouse

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccne2Q9Z238 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccne2Q9Z238 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccne2Q9Z238 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccne2Q9Z238 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccne2Q9Z238 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccne2Q9Z238 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccne2Q9Z238 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccne2Q9Z238 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccne2Q9Z238 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccne2Q9Z238 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccne2Q9Z238 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccne2Q9Z238 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccne2Q9Z238 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccne2Q9Z238 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccne2Q9Z238 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccne2Q9Z238 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccne2Q9Z238 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccne2Q9Z238 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccne2Q9Z238 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccne2Q9Z238 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccne2Q9Z238 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccne2Q9Z238 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccne2Q9Z238 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccne2Q9Z238 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccne2Q9Z238 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccne2Q9Z238 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccne2Q9Z238 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccne2Q9Z238 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccne2Q9Z238 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccne2Q9Z238 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccne2Q9Z238 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccne2Q9Z238 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccne2Q9Z238 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccne2Q9Z238 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccne2Q9Z238 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccne2Q9Z238 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccne2Q9Z238 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccne2Q9Z238 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccne2Q9Z238 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccne2Q9Z238 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccne2Q9Z238 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccne2Q9Z238 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccne2Q9Z238 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccne2Q9Z238 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccne2Q9Z238 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccne2Q9Z238 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccne2Q9Z238 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccne2Q9Z238 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccne2Q9Z238 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccne2Q9Z238 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccne2Q9Z238 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccne2Q9Z238 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccne2Q9Z238 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccne2Q9Z238 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccne2Q9Z238 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccne2Q9Z238 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccne2Q9Z238 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccne2Q9Z238 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccne2Q9Z238 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccne2Q9Z238 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccne2Q9Z238 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccne2Q9Z238 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccne2Q9Z238 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccne2Q9Z238 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccne2Q9Z238 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccne2Q9Z238 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccne2Q9Z238 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccne2Q9Z238 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccne2Q9Z238 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccne2Q9Z238 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccne2Q9Z238 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccne2Q9Z238 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccne2Q9Z238 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccne2Q9Z238 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccne2Q9Z238 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccne2Q9Z238 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccne2Q9Z238 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccne2Q9Z238 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccne2Q9Z238 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccne2Q9Z238 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccne2Q9Z238 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccne2Q9Z238 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccne2Q9Z238 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccne2Q9Z238 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccne2Q9Z238 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccne2Q9Z238 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccne2Q9Z238 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccne2Q9Z238 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccne2Q9Z238 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccne2Q9Z238 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccne2Q9Z238 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccne2Q9Z238 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccne2Q9Z238 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccne2Q9Z238 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccne2Q9Z238 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccne2Q9Z238 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccne2Q9Z238 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccne2Q9Z238 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccne2Q9Z238 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccne2Q9Z238 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.6 ms