Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1Q5

Clic1, Chloride intracellular channel protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 241 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clic1Q9Z1Q5 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Clic1Q9Z1Q5 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Clic1Q9Z1Q5 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Clic1Q9Z1Q5 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Clic1Q9Z1Q5 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Clic1Q9Z1Q5 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Clic1Q9Z1Q5 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Clic1Q9Z1Q5 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Clic1Q9Z1Q5 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Clic1Q9Z1Q5 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Clic1Q9Z1Q5 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Clic1Q9Z1Q5 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Clic1Q9Z1Q5 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Clic1Q9Z1Q5 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Clic1Q9Z1Q5 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Clic1Q9Z1Q5 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Clic1Q9Z1Q5 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Clic1Q9Z1Q5 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Clic1Q9Z1Q5 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Clic1Q9Z1Q5 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Clic1Q9Z1Q5 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Clic1Q9Z1Q5 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Clic1Q9Z1Q5 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Clic1Q9Z1Q5 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Clic1Q9Z1Q5 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Clic1Q9Z1Q5 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Clic1Q9Z1Q5 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Clic1Q9Z1Q5 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Clic1Q9Z1Q5 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Clic1Q9Z1Q5 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Clic1Q9Z1Q5 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Clic1Q9Z1Q5 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Clic1Q9Z1Q5 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Clic1Q9Z1Q5 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Clic1Q9Z1Q5 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Clic1Q9Z1Q5 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Clic1Q9Z1Q5 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Clic1Q9Z1Q5 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Clic1Q9Z1Q5 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Clic1Q9Z1Q5 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Clic1Q9Z1Q5 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Clic1Q9Z1Q5 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Clic1Q9Z1Q5 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Clic1Q9Z1Q5 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Clic1Q9Z1Q5 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Clic1Q9Z1Q5 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Clic1Q9Z1Q5 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Clic1Q9Z1Q5 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Clic1Q9Z1Q5 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Clic1Q9Z1Q5 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Clic1Q9Z1Q5 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Clic1Q9Z1Q5 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Clic1Q9Z1Q5 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Clic1Q9Z1Q5 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Clic1Q9Z1Q5 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Clic1Q9Z1Q5 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Clic1Q9Z1Q5 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Clic1Q9Z1Q5 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Clic1Q9Z1Q5 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Clic1Q9Z1Q5 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Clic1Q9Z1Q5 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Clic1Q9Z1Q5 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Clic1Q9Z1Q5 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Clic1Q9Z1Q5 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Clic1Q9Z1Q5 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Clic1Q9Z1Q5 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Clic1Q9Z1Q5 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Clic1Q9Z1Q5 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Clic1Q9Z1Q5 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Clic1Q9Z1Q5 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Clic1Q9Z1Q5 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Clic1Q9Z1Q5 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Clic1Q9Z1Q5 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Clic1Q9Z1Q5 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Clic1Q9Z1Q5 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Clic1Q9Z1Q5 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Clic1Q9Z1Q5 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Clic1Q9Z1Q5 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Clic1Q9Z1Q5 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Clic1Q9Z1Q5 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Clic1Q9Z1Q5 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Clic1Q9Z1Q5 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Clic1Q9Z1Q5 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Clic1Q9Z1Q5 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Clic1Q9Z1Q5 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Clic1Q9Z1Q5 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Clic1Q9Z1Q5 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Clic1Q9Z1Q5 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Clic1Q9Z1Q5 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Clic1Q9Z1Q5 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Clic1Q9Z1Q5 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Clic1Q9Z1Q5 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Clic1Q9Z1Q5 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Clic1Q9Z1Q5 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Clic1Q9Z1Q5 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Clic1Q9Z1Q5 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Clic1Q9Z1Q5 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Clic1Q9Z1Q5 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Clic1Q9Z1Q5 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Clic1Q9Z1Q5 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms